Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ57

Mterf1b, Transcription termination factor 1b, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1bB9EJ57 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mterf1bB9EJ57 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mterf1bB9EJ57 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mterf1bB9EJ57 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mterf1bB9EJ57 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mterf1bB9EJ57 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mterf1bB9EJ57 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mterf1bB9EJ57 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mterf1bB9EJ57 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mterf1bB9EJ57 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mterf1bB9EJ57 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mterf1bB9EJ57 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mterf1bB9EJ57 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mterf1bB9EJ57 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mterf1bB9EJ57 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mterf1bB9EJ57 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mterf1bB9EJ57 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mterf1bB9EJ57 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mterf1bB9EJ57 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mterf1bB9EJ57 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mterf1bB9EJ57 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mterf1bB9EJ57 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mterf1bB9EJ57 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mterf1bB9EJ57 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mterf1bB9EJ57 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mterf1bB9EJ57 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mterf1bB9EJ57 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mterf1bB9EJ57 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Mterf1bB9EJ57 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mterf1bB9EJ57 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mterf1bB9EJ57 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mterf1bB9EJ57 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mterf1bB9EJ57 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mterf1bB9EJ57 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mterf1bB9EJ57 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mterf1bB9EJ57 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mterf1bB9EJ57 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mterf1bB9EJ57 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mterf1bB9EJ57 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mterf1bB9EJ57 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mterf1bB9EJ57 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mterf1bB9EJ57 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mterf1bB9EJ57 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mterf1bB9EJ57 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mterf1bB9EJ57 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mterf1bB9EJ57 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mterf1bB9EJ57 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mterf1bB9EJ57 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mterf1bB9EJ57 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mterf1bB9EJ57 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mterf1bB9EJ57 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mterf1bB9EJ57 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mterf1bB9EJ57 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Mterf1bB9EJ57 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mterf1bB9EJ57 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mterf1bB9EJ57 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mterf1bB9EJ57 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mterf1bB9EJ57 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mterf1bB9EJ57 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mterf1bB9EJ57 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mterf1bB9EJ57 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mterf1bB9EJ57 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mterf1bB9EJ57 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mterf1bB9EJ57 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mterf1bB9EJ57 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mterf1bB9EJ57 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mterf1bB9EJ57 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mterf1bB9EJ57 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mterf1bB9EJ57 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mterf1bB9EJ57 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mterf1bB9EJ57 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mterf1bB9EJ57 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mterf1bB9EJ57 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mterf1bB9EJ57 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mterf1bB9EJ57 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mterf1bB9EJ57 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Mterf1bB9EJ57 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mterf1bB9EJ57 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mterf1bB9EJ57 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mterf1bB9EJ57 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mterf1bB9EJ57 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mterf1bB9EJ57 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mterf1bB9EJ57 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mterf1bB9EJ57 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mterf1bB9EJ57 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Mterf1bB9EJ57 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mterf1bB9EJ57 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mterf1bB9EJ57 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mterf1bB9EJ57 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mterf1bB9EJ57 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mterf1bB9EJ57 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Mterf1bB9EJ57 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mterf1bB9EJ57 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mterf1bB9EJ57 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mterf1bB9EJ57 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mterf1bB9EJ57 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mterf1bB9EJ57 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mterf1bB9EJ57 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mterf1bB9EJ57 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mterf1bB9EJ57 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms