Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Phf11bB4XVQ1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Phf11bB4XVQ1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Phf11bB4XVQ1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Phf11bB4XVQ1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Phf11bB4XVQ1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Phf11bB4XVQ1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Phf11bB4XVQ1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Phf11bB4XVQ1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Phf11bB4XVQ1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Phf11bB4XVQ1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Phf11bB4XVQ1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Phf11bB4XVQ1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Phf11bB4XVQ1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Phf11bB4XVQ1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Phf11bB4XVQ1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Phf11bB4XVQ1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Phf11bB4XVQ1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Phf11bB4XVQ1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Phf11bB4XVQ1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Phf11bB4XVQ1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Phf11bB4XVQ1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Phf11bB4XVQ1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Phf11bB4XVQ1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Phf11bB4XVQ1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Phf11bB4XVQ1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Phf11bB4XVQ1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Phf11bB4XVQ1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Phf11bB4XVQ1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Phf11bB4XVQ1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Phf11bB4XVQ1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Phf11bB4XVQ1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Phf11bB4XVQ1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Phf11bB4XVQ1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Phf11bB4XVQ1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Phf11bB4XVQ1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Phf11bB4XVQ1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Phf11bB4XVQ1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Phf11bB4XVQ1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Phf11bB4XVQ1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Phf11bB4XVQ1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Phf11bB4XVQ1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Phf11bB4XVQ1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Phf11bB4XVQ1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Phf11bB4XVQ1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Phf11bB4XVQ1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Phf11bB4XVQ1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Phf11bB4XVQ1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Phf11bB4XVQ1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Phf11bB4XVQ1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Phf11bB4XVQ1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Phf11bB4XVQ1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Phf11bB4XVQ1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Phf11bB4XVQ1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Phf11bB4XVQ1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Phf11bB4XVQ1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Phf11bB4XVQ1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Phf11bB4XVQ1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Phf11bB4XVQ1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Phf11bB4XVQ1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Phf11bB4XVQ1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Phf11bB4XVQ1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Phf11bB4XVQ1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Phf11bB4XVQ1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Phf11bB4XVQ1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Phf11bB4XVQ1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Phf11bB4XVQ1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Phf11bB4XVQ1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Phf11bB4XVQ1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Phf11bB4XVQ1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Phf11bB4XVQ1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Phf11bB4XVQ1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Phf11bB4XVQ1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Phf11bB4XVQ1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Phf11bB4XVQ1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Phf11bB4XVQ1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Phf11bB4XVQ1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Phf11bB4XVQ1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Phf11bB4XVQ1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Phf11bB4XVQ1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Phf11bB4XVQ1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Phf11bB4XVQ1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Phf11bB4XVQ1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Phf11bB4XVQ1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Phf11bB4XVQ1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Phf11bB4XVQ1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Phf11bB4XVQ1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Phf11bB4XVQ1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Phf11bB4XVQ1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Phf11bB4XVQ1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Phf11bB4XVQ1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Phf11bB4XVQ1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Phf11bB4XVQ1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Phf11bB4XVQ1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Phf11bB4XVQ1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Phf11bB4XVQ1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Phf11bB4XVQ1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Phf11bB4XVQ1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Phf11bB4XVQ1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Phf11bB4XVQ1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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