Protein–RNA interactions for Protein: B2RY53

Gm6133, EG620155 protein, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6133B2RY53 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm6133B2RY53 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm6133B2RY53 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm6133B2RY53 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm6133B2RY53 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm6133B2RY53 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm6133B2RY53 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm6133B2RY53 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm6133B2RY53 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm6133B2RY53 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm6133B2RY53 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm6133B2RY53 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm6133B2RY53 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm6133B2RY53 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm6133B2RY53 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm6133B2RY53 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm6133B2RY53 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm6133B2RY53 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm6133B2RY53 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm6133B2RY53 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm6133B2RY53 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm6133B2RY53 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm6133B2RY53 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm6133B2RY53 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm6133B2RY53 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm6133B2RY53 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gm6133B2RY53 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gm6133B2RY53 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm6133B2RY53 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm6133B2RY53 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm6133B2RY53 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm6133B2RY53 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm6133B2RY53 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm6133B2RY53 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm6133B2RY53 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm6133B2RY53 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm6133B2RY53 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm6133B2RY53 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm6133B2RY53 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm6133B2RY53 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm6133B2RY53 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm6133B2RY53 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm6133B2RY53 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm6133B2RY53 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm6133B2RY53 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm6133B2RY53 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm6133B2RY53 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm6133B2RY53 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm6133B2RY53 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm6133B2RY53 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm6133B2RY53 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm6133B2RY53 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm6133B2RY53 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm6133B2RY53 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm6133B2RY53 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm6133B2RY53 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm6133B2RY53 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm6133B2RY53 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm6133B2RY53 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm6133B2RY53 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm6133B2RY53 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm6133B2RY53 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm6133B2RY53 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm6133B2RY53 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm6133B2RY53 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm6133B2RY53 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm6133B2RY53 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm6133B2RY53 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm6133B2RY53 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm6133B2RY53 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm6133B2RY53 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm6133B2RY53 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm6133B2RY53 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm6133B2RY53 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm6133B2RY53 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm6133B2RY53 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm6133B2RY53 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm6133B2RY53 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm6133B2RY53 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm6133B2RY53 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm6133B2RY53 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm6133B2RY53 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm6133B2RY53 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm6133B2RY53 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm6133B2RY53 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm6133B2RY53 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm6133B2RY53 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm6133B2RY53 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm6133B2RY53 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm6133B2RY53 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm6133B2RY53 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm6133B2RY53 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm6133B2RY53 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm6133B2RY53 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm6133B2RY53 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm6133B2RY53 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm6133B2RY53 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm6133B2RY53 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm6133B2RY53 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm6133B2RY53 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms