Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyp26c1B2RXA7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyp26c1B2RXA7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyp26c1B2RXA7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyp26c1B2RXA7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyp26c1B2RXA7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyp26c1B2RXA7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyp26c1B2RXA7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyp26c1B2RXA7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyp26c1B2RXA7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyp26c1B2RXA7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyp26c1B2RXA7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyp26c1B2RXA7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyp26c1B2RXA7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyp26c1B2RXA7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyp26c1B2RXA7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyp26c1B2RXA7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyp26c1B2RXA7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyp26c1B2RXA7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyp26c1B2RXA7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyp26c1B2RXA7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyp26c1B2RXA7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyp26c1B2RXA7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyp26c1B2RXA7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyp26c1B2RXA7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyp26c1B2RXA7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyp26c1B2RXA7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.02■■□□□ 1.43
Cyp26c1B2RXA7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyp26c1B2RXA7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyp26c1B2RXA7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyp26c1B2RXA7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyp26c1B2RXA7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyp26c1B2RXA7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyp26c1B2RXA7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyp26c1B2RXA7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyp26c1B2RXA7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cyp26c1B2RXA7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cyp26c1B2RXA7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cyp26c1B2RXA7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cyp26c1B2RXA7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cyp26c1B2RXA7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cyp26c1B2RXA7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyp26c1B2RXA7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyp26c1B2RXA7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyp26c1B2RXA7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyp26c1B2RXA7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyp26c1B2RXA7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyp26c1B2RXA7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyp26c1B2RXA7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyp26c1B2RXA7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyp26c1B2RXA7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyp26c1B2RXA7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyp26c1B2RXA7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyp26c1B2RXA7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyp26c1B2RXA7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyp26c1B2RXA7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyp26c1B2RXA7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cyp26c1B2RXA7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Cyp26c1B2RXA7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cyp26c1B2RXA7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cyp26c1B2RXA7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cyp26c1B2RXA7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cyp26c1B2RXA7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cyp26c1B2RXA7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cyp26c1B2RXA7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cyp26c1B2RXA7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cyp26c1B2RXA7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cyp26c1B2RXA7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cyp26c1B2RXA7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cyp26c1B2RXA7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cyp26c1B2RXA7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cyp26c1B2RXA7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cyp26c1B2RXA7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cyp26c1B2RXA7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cyp26c1B2RXA7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cyp26c1B2RXA7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cyp26c1B2RXA7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cyp26c1B2RXA7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Cyp26c1B2RXA7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cyp26c1B2RXA7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cyp26c1B2RXA7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cyp26c1B2RXA7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cyp26c1B2RXA7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cyp26c1B2RXA7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cyp26c1B2RXA7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cyp26c1B2RXA7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cyp26c1B2RXA7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cyp26c1B2RXA7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cyp26c1B2RXA7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cyp26c1B2RXA7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cyp26c1B2RXA7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cyp26c1B2RXA7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cyp26c1B2RXA7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cyp26c1B2RXA7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cyp26c1B2RXA7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cyp26c1B2RXA7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cyp26c1B2RXA7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cyp26c1B2RXA7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cyp26c1B2RXA7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cyp26c1B2RXA7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms