Protein–RNA interactions for Protein: B2RVB7

Hbb-bh2, Globin b2, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbb-bh2B2RVB7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hbb-bh2B2RVB7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hbb-bh2B2RVB7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hbb-bh2B2RVB7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hbb-bh2B2RVB7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hbb-bh2B2RVB7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hbb-bh2B2RVB7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hbb-bh2B2RVB7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hbb-bh2B2RVB7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hbb-bh2B2RVB7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hbb-bh2B2RVB7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hbb-bh2B2RVB7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hbb-bh2B2RVB7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hbb-bh2B2RVB7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hbb-bh2B2RVB7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hbb-bh2B2RVB7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hbb-bh2B2RVB7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hbb-bh2B2RVB7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hbb-bh2B2RVB7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hbb-bh2B2RVB7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hbb-bh2B2RVB7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hbb-bh2B2RVB7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hbb-bh2B2RVB7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hbb-bh2B2RVB7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hbb-bh2B2RVB7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hbb-bh2B2RVB7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hbb-bh2B2RVB7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hbb-bh2B2RVB7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hbb-bh2B2RVB7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hbb-bh2B2RVB7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hbb-bh2B2RVB7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hbb-bh2B2RVB7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hbb-bh2B2RVB7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hbb-bh2B2RVB7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hbb-bh2B2RVB7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hbb-bh2B2RVB7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hbb-bh2B2RVB7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hbb-bh2B2RVB7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Hbb-bh2B2RVB7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Hbb-bh2B2RVB7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hbb-bh2B2RVB7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hbb-bh2B2RVB7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hbb-bh2B2RVB7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hbb-bh2B2RVB7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hbb-bh2B2RVB7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Hbb-bh2B2RVB7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hbb-bh2B2RVB7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hbb-bh2B2RVB7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hbb-bh2B2RVB7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hbb-bh2B2RVB7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hbb-bh2B2RVB7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hbb-bh2B2RVB7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hbb-bh2B2RVB7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hbb-bh2B2RVB7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hbb-bh2B2RVB7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hbb-bh2B2RVB7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hbb-bh2B2RVB7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hbb-bh2B2RVB7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hbb-bh2B2RVB7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hbb-bh2B2RVB7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hbb-bh2B2RVB7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hbb-bh2B2RVB7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hbb-bh2B2RVB7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hbb-bh2B2RVB7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hbb-bh2B2RVB7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hbb-bh2B2RVB7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hbb-bh2B2RVB7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hbb-bh2B2RVB7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hbb-bh2B2RVB7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hbb-bh2B2RVB7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hbb-bh2B2RVB7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hbb-bh2B2RVB7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hbb-bh2B2RVB7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hbb-bh2B2RVB7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hbb-bh2B2RVB7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hbb-bh2B2RVB7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hbb-bh2B2RVB7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hbb-bh2B2RVB7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hbb-bh2B2RVB7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hbb-bh2B2RVB7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hbb-bh2B2RVB7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hbb-bh2B2RVB7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Hbb-bh2B2RVB7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hbb-bh2B2RVB7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hbb-bh2B2RVB7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hbb-bh2B2RVB7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hbb-bh2B2RVB7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Hbb-bh2B2RVB7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Hbb-bh2B2RVB7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hbb-bh2B2RVB7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hbb-bh2B2RVB7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hbb-bh2B2RVB7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hbb-bh2B2RVB7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hbb-bh2B2RVB7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hbb-bh2B2RVB7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hbb-bh2B2RVB7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hbb-bh2B2RVB7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hbb-bh2B2RVB7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms