Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Apba1B2RUJ5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Apba1B2RUJ5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Apba1B2RUJ5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Apba1B2RUJ5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Apba1B2RUJ5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Apba1B2RUJ5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Apba1B2RUJ5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Apba1B2RUJ5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Apba1B2RUJ5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Apba1B2RUJ5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apba1B2RUJ5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Apba1B2RUJ5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Apba1B2RUJ5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apba1B2RUJ5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apba1B2RUJ5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apba1B2RUJ5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apba1B2RUJ5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apba1B2RUJ5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apba1B2RUJ5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apba1B2RUJ5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Apba1B2RUJ5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apba1B2RUJ5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apba1B2RUJ5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apba1B2RUJ5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apba1B2RUJ5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apba1B2RUJ5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apba1B2RUJ5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apba1B2RUJ5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apba1B2RUJ5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apba1B2RUJ5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apba1B2RUJ5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apba1B2RUJ5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apba1B2RUJ5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apba1B2RUJ5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Apba1B2RUJ5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Apba1B2RUJ5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Apba1B2RUJ5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Apba1B2RUJ5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Apba1B2RUJ5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Apba1B2RUJ5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Apba1B2RUJ5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apba1B2RUJ5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apba1B2RUJ5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apba1B2RUJ5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Apba1B2RUJ5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apba1B2RUJ5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apba1B2RUJ5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apba1B2RUJ5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apba1B2RUJ5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apba1B2RUJ5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apba1B2RUJ5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Apba1B2RUJ5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Apba1B2RUJ5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Apba1B2RUJ5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Apba1B2RUJ5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Apba1B2RUJ5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Apba1B2RUJ5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Apba1B2RUJ5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Apba1B2RUJ5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Apba1B2RUJ5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Apba1B2RUJ5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Apba1B2RUJ5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Apba1B2RUJ5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Apba1B2RUJ5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Apba1B2RUJ5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Apba1B2RUJ5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Apba1B2RUJ5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Apba1B2RUJ5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Apba1B2RUJ5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apba1B2RUJ5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apba1B2RUJ5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apba1B2RUJ5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apba1B2RUJ5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apba1B2RUJ5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apba1B2RUJ5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apba1B2RUJ5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apba1B2RUJ5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apba1B2RUJ5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apba1B2RUJ5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apba1B2RUJ5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apba1B2RUJ5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apba1B2RUJ5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apba1B2RUJ5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Apba1B2RUJ5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apba1B2RUJ5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apba1B2RUJ5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apba1B2RUJ5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apba1B2RUJ5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apba1B2RUJ5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apba1B2RUJ5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apba1B2RUJ5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apba1B2RUJ5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apba1B2RUJ5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apba1B2RUJ5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apba1B2RUJ5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apba1B2RUJ5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apba1B2RUJ5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apba1B2RUJ5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apba1B2RUJ5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms