Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC2

Usp42, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp42B2RQC2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp42B2RQC2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp42B2RQC2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp42B2RQC2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp42B2RQC2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp42B2RQC2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Usp42B2RQC2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Usp42B2RQC2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp42B2RQC2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp42B2RQC2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp42B2RQC2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp42B2RQC2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp42B2RQC2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp42B2RQC2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp42B2RQC2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp42B2RQC2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp42B2RQC2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp42B2RQC2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp42B2RQC2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp42B2RQC2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp42B2RQC2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp42B2RQC2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp42B2RQC2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp42B2RQC2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp42B2RQC2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp42B2RQC2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp42B2RQC2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp42B2RQC2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp42B2RQC2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp42B2RQC2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp42B2RQC2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp42B2RQC2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp42B2RQC2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp42B2RQC2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp42B2RQC2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp42B2RQC2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp42B2RQC2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp42B2RQC2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp42B2RQC2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp42B2RQC2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp42B2RQC2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp42B2RQC2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp42B2RQC2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp42B2RQC2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp42B2RQC2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp42B2RQC2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp42B2RQC2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp42B2RQC2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp42B2RQC2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp42B2RQC2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp42B2RQC2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp42B2RQC2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp42B2RQC2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp42B2RQC2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp42B2RQC2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp42B2RQC2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp42B2RQC2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp42B2RQC2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp42B2RQC2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp42B2RQC2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp42B2RQC2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp42B2RQC2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp42B2RQC2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp42B2RQC2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp42B2RQC2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp42B2RQC2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp42B2RQC2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp42B2RQC2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp42B2RQC2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp42B2RQC2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp42B2RQC2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp42B2RQC2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp42B2RQC2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp42B2RQC2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp42B2RQC2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp42B2RQC2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp42B2RQC2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp42B2RQC2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp42B2RQC2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp42B2RQC2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp42B2RQC2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp42B2RQC2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp42B2RQC2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp42B2RQC2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp42B2RQC2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp42B2RQC2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp42B2RQC2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp42B2RQC2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp42B2RQC2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp42B2RQC2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp42B2RQC2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp42B2RQC2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp42B2RQC2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp42B2RQC2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp42B2RQC2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp42B2RQC2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp42B2RQC2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp42B2RQC2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp42B2RQC2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp42B2RQC2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms