Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nipsnap3aB1AWZ3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nipsnap3aB1AWZ3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nipsnap3aB1AWZ3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nipsnap3aB1AWZ3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nipsnap3aB1AWZ3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nipsnap3aB1AWZ3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nipsnap3aB1AWZ3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nipsnap3aB1AWZ3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nipsnap3aB1AWZ3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nipsnap3aB1AWZ3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nipsnap3aB1AWZ3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nipsnap3aB1AWZ3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nipsnap3aB1AWZ3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nipsnap3aB1AWZ3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nipsnap3aB1AWZ3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nipsnap3aB1AWZ3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nipsnap3aB1AWZ3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nipsnap3aB1AWZ3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nipsnap3aB1AWZ3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nipsnap3aB1AWZ3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nipsnap3aB1AWZ3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nipsnap3aB1AWZ3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nipsnap3aB1AWZ3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nipsnap3aB1AWZ3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nipsnap3aB1AWZ3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nipsnap3aB1AWZ3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nipsnap3aB1AWZ3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nipsnap3aB1AWZ3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nipsnap3aB1AWZ3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nipsnap3aB1AWZ3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nipsnap3aB1AWZ3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nipsnap3aB1AWZ3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nipsnap3aB1AWZ3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nipsnap3aB1AWZ3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nipsnap3aB1AWZ3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nipsnap3aB1AWZ3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nipsnap3aB1AWZ3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Nipsnap3aB1AWZ3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nipsnap3aB1AWZ3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nipsnap3aB1AWZ3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nipsnap3aB1AWZ3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nipsnap3aB1AWZ3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nipsnap3aB1AWZ3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Nipsnap3aB1AWZ3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nipsnap3aB1AWZ3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nipsnap3aB1AWZ3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nipsnap3aB1AWZ3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nipsnap3aB1AWZ3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nipsnap3aB1AWZ3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Nipsnap3aB1AWZ3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nipsnap3aB1AWZ3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nipsnap3aB1AWZ3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nipsnap3aB1AWZ3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nipsnap3aB1AWZ3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nipsnap3aB1AWZ3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nipsnap3aB1AWZ3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Nipsnap3aB1AWZ3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nipsnap3aB1AWZ3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nipsnap3aB1AWZ3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Nipsnap3aB1AWZ3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nipsnap3aB1AWZ3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Nipsnap3aB1AWZ3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nipsnap3aB1AWZ3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nipsnap3aB1AWZ3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nipsnap3aB1AWZ3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nipsnap3aB1AWZ3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nipsnap3aB1AWZ3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nipsnap3aB1AWZ3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nipsnap3aB1AWZ3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Nipsnap3aB1AWZ3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nipsnap3aB1AWZ3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nipsnap3aB1AWZ3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nipsnap3aB1AWZ3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Nipsnap3aB1AWZ3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms