Protein–RNA interactions for Protein: B1AQ75

Krt36, Keratin, type I cuticular Ha6, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt36B1AQ75 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt36B1AQ75 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt36B1AQ75 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt36B1AQ75 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt36B1AQ75 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt36B1AQ75 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt36B1AQ75 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt36B1AQ75 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt36B1AQ75 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt36B1AQ75 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt36B1AQ75 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt36B1AQ75 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt36B1AQ75 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt36B1AQ75 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt36B1AQ75 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt36B1AQ75 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt36B1AQ75 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt36B1AQ75 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt36B1AQ75 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt36B1AQ75 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt36B1AQ75 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt36B1AQ75 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt36B1AQ75 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt36B1AQ75 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt36B1AQ75 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt36B1AQ75 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt36B1AQ75 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt36B1AQ75 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt36B1AQ75 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt36B1AQ75 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt36B1AQ75 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt36B1AQ75 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt36B1AQ75 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt36B1AQ75 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt36B1AQ75 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt36B1AQ75 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt36B1AQ75 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt36B1AQ75 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt36B1AQ75 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt36B1AQ75 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt36B1AQ75 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt36B1AQ75 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt36B1AQ75 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt36B1AQ75 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt36B1AQ75 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt36B1AQ75 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt36B1AQ75 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt36B1AQ75 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt36B1AQ75 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt36B1AQ75 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt36B1AQ75 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt36B1AQ75 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt36B1AQ75 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt36B1AQ75 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt36B1AQ75 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt36B1AQ75 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt36B1AQ75 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt36B1AQ75 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt36B1AQ75 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt36B1AQ75 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt36B1AQ75 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt36B1AQ75 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt36B1AQ75 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt36B1AQ75 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt36B1AQ75 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt36B1AQ75 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt36B1AQ75 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt36B1AQ75 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt36B1AQ75 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt36B1AQ75 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt36B1AQ75 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt36B1AQ75 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt36B1AQ75 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt36B1AQ75 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt36B1AQ75 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt36B1AQ75 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt36B1AQ75 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt36B1AQ75 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt36B1AQ75 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt36B1AQ75 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt36B1AQ75 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt36B1AQ75 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt36B1AQ75 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt36B1AQ75 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt36B1AQ75 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt36B1AQ75 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt36B1AQ75 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt36B1AQ75 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt36B1AQ75 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt36B1AQ75 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt36B1AQ75 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt36B1AQ75 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt36B1AQ75 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt36B1AQ75 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt36B1AQ75 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt36B1AQ75 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt36B1AQ75 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt36B1AQ75 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt36B1AQ75 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt36B1AQ75 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms