Protein–RNA interactions for Protein: A3KG59

Pm20d2, Peptidase M20 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pm20d2A3KG59 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pm20d2A3KG59 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pm20d2A3KG59 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pm20d2A3KG59 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pm20d2A3KG59 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pm20d2A3KG59 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pm20d2A3KG59 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pm20d2A3KG59 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pm20d2A3KG59 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pm20d2A3KG59 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pm20d2A3KG59 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pm20d2A3KG59 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pm20d2A3KG59 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pm20d2A3KG59 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pm20d2A3KG59 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pm20d2A3KG59 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Pm20d2A3KG59 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pm20d2A3KG59 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pm20d2A3KG59 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pm20d2A3KG59 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pm20d2A3KG59 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pm20d2A3KG59 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pm20d2A3KG59 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pm20d2A3KG59 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pm20d2A3KG59 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pm20d2A3KG59 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Pm20d2A3KG59 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pm20d2A3KG59 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Pm20d2A3KG59 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pm20d2A3KG59 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pm20d2A3KG59 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pm20d2A3KG59 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pm20d2A3KG59 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pm20d2A3KG59 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pm20d2A3KG59 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pm20d2A3KG59 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pm20d2A3KG59 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pm20d2A3KG59 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pm20d2A3KG59 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pm20d2A3KG59 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pm20d2A3KG59 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pm20d2A3KG59 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pm20d2A3KG59 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pm20d2A3KG59 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pm20d2A3KG59 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pm20d2A3KG59 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pm20d2A3KG59 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pm20d2A3KG59 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pm20d2A3KG59 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pm20d2A3KG59 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pm20d2A3KG59 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pm20d2A3KG59 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pm20d2A3KG59 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pm20d2A3KG59 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pm20d2A3KG59 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pm20d2A3KG59 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pm20d2A3KG59 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pm20d2A3KG59 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pm20d2A3KG59 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pm20d2A3KG59 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pm20d2A3KG59 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pm20d2A3KG59 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pm20d2A3KG59 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pm20d2A3KG59 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pm20d2A3KG59 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pm20d2A3KG59 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pm20d2A3KG59 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pm20d2A3KG59 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pm20d2A3KG59 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pm20d2A3KG59 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pm20d2A3KG59 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pm20d2A3KG59 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pm20d2A3KG59 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pm20d2A3KG59 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pm20d2A3KG59 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pm20d2A3KG59 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pm20d2A3KG59 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pm20d2A3KG59 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pm20d2A3KG59 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pm20d2A3KG59 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pm20d2A3KG59 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pm20d2A3KG59 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pm20d2A3KG59 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pm20d2A3KG59 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pm20d2A3KG59 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pm20d2A3KG59 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pm20d2A3KG59 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pm20d2A3KG59 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pm20d2A3KG59 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pm20d2A3KG59 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pm20d2A3KG59 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pm20d2A3KG59 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pm20d2A3KG59 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pm20d2A3KG59 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pm20d2A3KG59 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pm20d2A3KG59 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pm20d2A3KG59 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pm20d2A3KG59 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pm20d2A3KG59 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pm20d2A3KG59 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms