Protein–RNA interactions for Protein: A2APU8

Fam205a, Protein FAM205A, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam205aA2APU8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam205aA2APU8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam205aA2APU8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam205aA2APU8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam205aA2APU8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam205aA2APU8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam205aA2APU8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam205aA2APU8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam205aA2APU8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam205aA2APU8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam205aA2APU8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam205aA2APU8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam205aA2APU8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam205aA2APU8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam205aA2APU8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam205aA2APU8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam205aA2APU8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam205aA2APU8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam205aA2APU8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam205aA2APU8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam205aA2APU8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam205aA2APU8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam205aA2APU8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam205aA2APU8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam205aA2APU8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam205aA2APU8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam205aA2APU8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam205aA2APU8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam205aA2APU8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam205aA2APU8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam205aA2APU8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam205aA2APU8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam205aA2APU8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam205aA2APU8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam205aA2APU8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam205aA2APU8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam205aA2APU8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam205aA2APU8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam205aA2APU8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam205aA2APU8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam205aA2APU8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam205aA2APU8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam205aA2APU8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam205aA2APU8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam205aA2APU8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam205aA2APU8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam205aA2APU8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam205aA2APU8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam205aA2APU8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam205aA2APU8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam205aA2APU8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam205aA2APU8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam205aA2APU8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam205aA2APU8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam205aA2APU8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam205aA2APU8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam205aA2APU8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam205aA2APU8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam205aA2APU8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam205aA2APU8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam205aA2APU8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam205aA2APU8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam205aA2APU8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam205aA2APU8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam205aA2APU8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam205aA2APU8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam205aA2APU8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam205aA2APU8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam205aA2APU8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam205aA2APU8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam205aA2APU8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam205aA2APU8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam205aA2APU8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam205aA2APU8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam205aA2APU8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam205aA2APU8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fam205aA2APU8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fam205aA2APU8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Fam205aA2APU8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fam205aA2APU8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam205aA2APU8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam205aA2APU8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam205aA2APU8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam205aA2APU8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam205aA2APU8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam205aA2APU8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam205aA2APU8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam205aA2APU8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam205aA2APU8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam205aA2APU8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam205aA2APU8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam205aA2APU8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam205aA2APU8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam205aA2APU8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam205aA2APU8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam205aA2APU8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam205aA2APU8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam205aA2APU8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam205aA2APU8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam205aA2APU8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms