Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ttll9A2APC3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ttll9A2APC3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ttll9A2APC3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ttll9A2APC3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ttll9A2APC3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ttll9A2APC3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ttll9A2APC3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ttll9A2APC3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ttll9A2APC3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ttll9A2APC3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ttll9A2APC3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ttll9A2APC3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ttll9A2APC3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ttll9A2APC3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ttll9A2APC3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ttll9A2APC3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ttll9A2APC3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ttll9A2APC3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ttll9A2APC3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ttll9A2APC3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ttll9A2APC3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ttll9A2APC3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ttll9A2APC3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ttll9A2APC3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ttll9A2APC3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ttll9A2APC3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Ttll9A2APC3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ttll9A2APC3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ttll9A2APC3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ttll9A2APC3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ttll9A2APC3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ttll9A2APC3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ttll9A2APC3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ttll9A2APC3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ttll9A2APC3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ttll9A2APC3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ttll9A2APC3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ttll9A2APC3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ttll9A2APC3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ttll9A2APC3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ttll9A2APC3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ttll9A2APC3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttll9A2APC3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttll9A2APC3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttll9A2APC3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttll9A2APC3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttll9A2APC3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttll9A2APC3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttll9A2APC3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttll9A2APC3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttll9A2APC3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttll9A2APC3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttll9A2APC3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttll9A2APC3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttll9A2APC3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttll9A2APC3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttll9A2APC3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttll9A2APC3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ttll9A2APC3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ttll9A2APC3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ttll9A2APC3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ttll9A2APC3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ttll9A2APC3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ttll9A2APC3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ttll9A2APC3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ttll9A2APC3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ttll9A2APC3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ttll9A2APC3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ttll9A2APC3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ttll9A2APC3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ttll9A2APC3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ttll9A2APC3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ttll9A2APC3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ttll9A2APC3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ttll9A2APC3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ttll9A2APC3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ttll9A2APC3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ttll9A2APC3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ttll9A2APC3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ttll9A2APC3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ttll9A2APC3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ttll9A2APC3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ttll9A2APC3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Ttll9A2APC3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Ttll9A2APC3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ttll9A2APC3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ttll9A2APC3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ttll9A2APC3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ttll9A2APC3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ttll9A2APC3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ttll9A2APC3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ttll9A2APC3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ttll9A2APC3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ttll9A2APC3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ttll9A2APC3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ttll9A2APC3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ttll9A2APC3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ttll9A2APC3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ttll9A2APC3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms