Protein–RNA interactions for Protein: A2A4P4

Gm27029, Predicted gene, 27029, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27029A2A4P4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm27029A2A4P4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm27029A2A4P4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm27029A2A4P4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm27029A2A4P4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gm27029A2A4P4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm27029A2A4P4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm27029A2A4P4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm27029A2A4P4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm27029A2A4P4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm27029A2A4P4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm27029A2A4P4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm27029A2A4P4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm27029A2A4P4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm27029A2A4P4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm27029A2A4P4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm27029A2A4P4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm27029A2A4P4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm27029A2A4P4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm27029A2A4P4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm27029A2A4P4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm27029A2A4P4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm27029A2A4P4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm27029A2A4P4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm27029A2A4P4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm27029A2A4P4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm27029A2A4P4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm27029A2A4P4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm27029A2A4P4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm27029A2A4P4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm27029A2A4P4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm27029A2A4P4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm27029A2A4P4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm27029A2A4P4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm27029A2A4P4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm27029A2A4P4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm27029A2A4P4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm27029A2A4P4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm27029A2A4P4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm27029A2A4P4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm27029A2A4P4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm27029A2A4P4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm27029A2A4P4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm27029A2A4P4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm27029A2A4P4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm27029A2A4P4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm27029A2A4P4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gm27029A2A4P4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm27029A2A4P4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm27029A2A4P4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm27029A2A4P4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm27029A2A4P4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm27029A2A4P4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm27029A2A4P4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm27029A2A4P4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm27029A2A4P4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm27029A2A4P4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm27029A2A4P4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm27029A2A4P4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm27029A2A4P4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm27029A2A4P4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm27029A2A4P4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm27029A2A4P4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm27029A2A4P4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm27029A2A4P4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm27029A2A4P4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm27029A2A4P4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm27029A2A4P4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm27029A2A4P4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm27029A2A4P4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm27029A2A4P4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm27029A2A4P4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm27029A2A4P4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm27029A2A4P4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm27029A2A4P4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm27029A2A4P4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm27029A2A4P4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm27029A2A4P4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm27029A2A4P4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm27029A2A4P4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm27029A2A4P4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm27029A2A4P4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm27029A2A4P4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm27029A2A4P4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm27029A2A4P4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm27029A2A4P4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm27029A2A4P4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm27029A2A4P4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm27029A2A4P4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm27029A2A4P4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm27029A2A4P4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm27029A2A4P4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm27029A2A4P4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm27029A2A4P4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm27029A2A4P4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm27029A2A4P4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm27029A2A4P4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm27029A2A4P4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm27029A2A4P4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm27029A2A4P4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms