Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YDU8

Cc2d2b, Coiled-coil and C2 domain containing 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cc2d2bA0A286YDU8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
Cc2d2bA0A286YDU8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Cc2d2bA0A286YDU8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
Cc2d2bA0A286YDU8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
Cc2d2bA0A286YDU8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Cc2d2bA0A286YDU8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Cc2d2bA0A286YDU8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Cc2d2bA0A286YDU8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
Cc2d2bA0A286YDU8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Cc2d2bA0A286YDU8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
Cc2d2bA0A286YDU8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Cc2d2bA0A286YDU8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Cc2d2bA0A286YDU8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Cc2d2bA0A286YDU8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Cc2d2bA0A286YDU8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Cc2d2bA0A286YDU8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Cc2d2bA0A286YDU8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Cc2d2bA0A286YDU8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Cc2d2bA0A286YDU8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Cc2d2bA0A286YDU8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Cc2d2bA0A286YDU8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Cc2d2bA0A286YDU8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.02
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
Cc2d2bA0A286YDU8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
Cc2d2bA0A286YDU8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Cc2d2bA0A286YDU8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.02
Cc2d2bA0A286YDU8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.02
Cc2d2bA0A286YDU8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Cc2d2bA0A286YDU8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Cc2d2bA0A286YDU8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Cc2d2bA0A286YDU8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Cc2d2bA0A286YDU8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Cc2d2bA0A286YDU8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Cc2d2bA0A286YDU8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Cc2d2bA0A286YDU8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Cc2d2bA0A286YDU8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Cc2d2bA0A286YDU8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Cc2d2bA0A286YDU8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Cc2d2bA0A286YDU8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Cc2d2bA0A286YDU8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Cc2d2bA0A286YDU8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Cc2d2bA0A286YDU8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Cc2d2bA0A286YDU8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Cc2d2bA0A286YDU8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
Cc2d2bA0A286YDU8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Cc2d2bA0A286YDU8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Cc2d2bA0A286YDU8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Cc2d2bA0A286YDU8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Cc2d2bA0A286YDU8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Cc2d2bA0A286YDU8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Cc2d2bA0A286YDU8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Cc2d2bA0A286YDU8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Cc2d2bA0A286YDU8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Cc2d2bA0A286YDU8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Cc2d2bA0A286YDU8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Cc2d2bA0A286YDU8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Cc2d2bA0A286YDU8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Cc2d2bA0A286YDU8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Cc2d2bA0A286YDU8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Cc2d2bA0A286YDU8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Cc2d2bA0A286YDU8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Cc2d2bA0A286YDU8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Cc2d2bA0A286YDU8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Cc2d2bA0A286YDU8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Cc2d2bA0A286YDU8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Cc2d2bA0A286YDU8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC33.8■■■■□ 3
Cc2d2bA0A286YDU8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Cc2d2bA0A286YDU8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Cc2d2bA0A286YDU8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Cc2d2bA0A286YDU8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Cc2d2bA0A286YDU8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Cc2d2bA0A286YDU8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Cc2d2bA0A286YDU8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Cc2d2bA0A286YDU8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Cc2d2bA0A286YDU8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Cc2d2bA0A286YDU8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Cc2d2bA0A286YDU8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Cc2d2bA0A286YDU8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Cc2d2bA0A286YDU8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Cc2d2bA0A286YDU8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Cc2d2bA0A286YDU8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Cc2d2bA0A286YDU8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Cc2d2bA0A286YDU8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Cc2d2bA0A286YDU8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms