Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Knop1Q9Z2Q2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Knop1Q9Z2Q2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Knop1Q9Z2Q2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Knop1Q9Z2Q2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Knop1Q9Z2Q2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Knop1Q9Z2Q2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Knop1Q9Z2Q2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Knop1Q9Z2Q2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Knop1Q9Z2Q2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Knop1Q9Z2Q2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Knop1Q9Z2Q2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Knop1Q9Z2Q2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Knop1Q9Z2Q2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Knop1Q9Z2Q2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Knop1Q9Z2Q2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Knop1Q9Z2Q2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Knop1Q9Z2Q2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Knop1Q9Z2Q2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Knop1Q9Z2Q2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Knop1Q9Z2Q2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Knop1Q9Z2Q2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Knop1Q9Z2Q2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Knop1Q9Z2Q2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Knop1Q9Z2Q2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Knop1Q9Z2Q2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Knop1Q9Z2Q2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Knop1Q9Z2Q2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Knop1Q9Z2Q2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Knop1Q9Z2Q2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Knop1Q9Z2Q2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Knop1Q9Z2Q2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Knop1Q9Z2Q2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Knop1Q9Z2Q2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Knop1Q9Z2Q2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Knop1Q9Z2Q2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Knop1Q9Z2Q2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Knop1Q9Z2Q2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Knop1Q9Z2Q2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Knop1Q9Z2Q2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Knop1Q9Z2Q2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Knop1Q9Z2Q2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Knop1Q9Z2Q2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Knop1Q9Z2Q2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Knop1Q9Z2Q2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Knop1Q9Z2Q2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Knop1Q9Z2Q2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Knop1Q9Z2Q2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Knop1Q9Z2Q2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Knop1Q9Z2Q2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Knop1Q9Z2Q2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Knop1Q9Z2Q2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Knop1Q9Z2Q2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Knop1Q9Z2Q2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Knop1Q9Z2Q2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Knop1Q9Z2Q2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Knop1Q9Z2Q2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Knop1Q9Z2Q2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Knop1Q9Z2Q2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Knop1Q9Z2Q2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Knop1Q9Z2Q2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Knop1Q9Z2Q2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Knop1Q9Z2Q2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Knop1Q9Z2Q2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Knop1Q9Z2Q2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Knop1Q9Z2Q2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Knop1Q9Z2Q2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Knop1Q9Z2Q2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Knop1Q9Z2Q2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Knop1Q9Z2Q2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Knop1Q9Z2Q2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Knop1Q9Z2Q2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Knop1Q9Z2Q2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Knop1Q9Z2Q2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Knop1Q9Z2Q2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Knop1Q9Z2Q2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Knop1Q9Z2Q2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Knop1Q9Z2Q2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Knop1Q9Z2Q2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Knop1Q9Z2Q2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Knop1Q9Z2Q2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Knop1Q9Z2Q2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Knop1Q9Z2Q2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Knop1Q9Z2Q2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Knop1Q9Z2Q2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Knop1Q9Z2Q2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Knop1Q9Z2Q2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Knop1Q9Z2Q2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Knop1Q9Z2Q2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Knop1Q9Z2Q2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Knop1Q9Z2Q2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Knop1Q9Z2Q2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Knop1Q9Z2Q2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Knop1Q9Z2Q2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Knop1Q9Z2Q2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Knop1Q9Z2Q2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Knop1Q9Z2Q2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Knop1Q9Z2Q2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Knop1Q9Z2Q2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms