Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VarsQ9Z1Q9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VarsQ9Z1Q9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VarsQ9Z1Q9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VarsQ9Z1Q9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
VarsQ9Z1Q9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VarsQ9Z1Q9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VarsQ9Z1Q9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VarsQ9Z1Q9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VarsQ9Z1Q9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VarsQ9Z1Q9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VarsQ9Z1Q9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VarsQ9Z1Q9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VarsQ9Z1Q9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VarsQ9Z1Q9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VarsQ9Z1Q9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VarsQ9Z1Q9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VarsQ9Z1Q9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VarsQ9Z1Q9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VarsQ9Z1Q9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
VarsQ9Z1Q9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VarsQ9Z1Q9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
VarsQ9Z1Q9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VarsQ9Z1Q9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VarsQ9Z1Q9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VarsQ9Z1Q9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
VarsQ9Z1Q9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
VarsQ9Z1Q9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VarsQ9Z1Q9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
VarsQ9Z1Q9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VarsQ9Z1Q9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VarsQ9Z1Q9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VarsQ9Z1Q9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VarsQ9Z1Q9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
VarsQ9Z1Q9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VarsQ9Z1Q9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VarsQ9Z1Q9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VarsQ9Z1Q9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VarsQ9Z1Q9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VarsQ9Z1Q9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VarsQ9Z1Q9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VarsQ9Z1Q9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VarsQ9Z1Q9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VarsQ9Z1Q9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VarsQ9Z1Q9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VarsQ9Z1Q9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VarsQ9Z1Q9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VarsQ9Z1Q9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VarsQ9Z1Q9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VarsQ9Z1Q9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VarsQ9Z1Q9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VarsQ9Z1Q9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VarsQ9Z1Q9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VarsQ9Z1Q9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VarsQ9Z1Q9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VarsQ9Z1Q9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
VarsQ9Z1Q9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VarsQ9Z1Q9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
VarsQ9Z1Q9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VarsQ9Z1Q9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VarsQ9Z1Q9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VarsQ9Z1Q9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VarsQ9Z1Q9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VarsQ9Z1Q9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VarsQ9Z1Q9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VarsQ9Z1Q9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VarsQ9Z1Q9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VarsQ9Z1Q9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VarsQ9Z1Q9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VarsQ9Z1Q9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VarsQ9Z1Q9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
VarsQ9Z1Q9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VarsQ9Z1Q9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VarsQ9Z1Q9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VarsQ9Z1Q9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
VarsQ9Z1Q9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VarsQ9Z1Q9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VarsQ9Z1Q9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VarsQ9Z1Q9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VarsQ9Z1Q9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VarsQ9Z1Q9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VarsQ9Z1Q9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
VarsQ9Z1Q9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VarsQ9Z1Q9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VarsQ9Z1Q9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VarsQ9Z1Q9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VarsQ9Z1Q9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VarsQ9Z1Q9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VarsQ9Z1Q9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VarsQ9Z1Q9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VarsQ9Z1Q9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
VarsQ9Z1Q9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VarsQ9Z1Q9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VarsQ9Z1Q9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VarsQ9Z1Q9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VarsQ9Z1Q9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VarsQ9Z1Q9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VarsQ9Z1Q9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VarsQ9Z1Q9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VarsQ9Z1Q9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms