Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Nup160Q9Z0W3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Nup160Q9Z0W3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Nup160Q9Z0W3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
Nup160Q9Z0W3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Nup160Q9Z0W3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Nup160Q9Z0W3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Nup160Q9Z0W3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
Nup160Q9Z0W3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Nup160Q9Z0W3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Nup160Q9Z0W3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Nup160Q9Z0W3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
Nup160Q9Z0W3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Nup160Q9Z0W3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Nup160Q9Z0W3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Nup160Q9Z0W3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Nup160Q9Z0W3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Nup160Q9Z0W3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Nup160Q9Z0W3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Nup160Q9Z0W3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Nup160Q9Z0W3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Nup160Q9Z0W3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Nup160Q9Z0W3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Nup160Q9Z0W3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Nup160Q9Z0W3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Nup160Q9Z0W3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Nup160Q9Z0W3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
Nup160Q9Z0W3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
Nup160Q9Z0W3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Nup160Q9Z0W3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Nup160Q9Z0W3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Nup160Q9Z0W3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
Nup160Q9Z0W3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Nup160Q9Z0W3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
Nup160Q9Z0W3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Nup160Q9Z0W3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Nup160Q9Z0W3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Nup160Q9Z0W3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Nup160Q9Z0W3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Nup160Q9Z0W3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Nup160Q9Z0W3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Nup160Q9Z0W3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Nup160Q9Z0W3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Nup160Q9Z0W3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
Nup160Q9Z0W3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
Nup160Q9Z0W3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Nup160Q9Z0W3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Nup160Q9Z0W3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Nup160Q9Z0W3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Nup160Q9Z0W3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Nup160Q9Z0W3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Nup160Q9Z0W3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Nup160Q9Z0W3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Nup160Q9Z0W3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Nup160Q9Z0W3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Nup160Q9Z0W3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Nup160Q9Z0W3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
Nup160Q9Z0W3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.06
Nup160Q9Z0W3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Nup160Q9Z0W3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Nup160Q9Z0W3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Nup160Q9Z0W3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Nup160Q9Z0W3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Nup160Q9Z0W3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Nup160Q9Z0W3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Nup160Q9Z0W3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Nup160Q9Z0W3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Nup160Q9Z0W3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Nup160Q9Z0W3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Nup160Q9Z0W3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
Nup160Q9Z0W3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Nup160Q9Z0W3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Nup160Q9Z0W3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Nup160Q9Z0W3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Nup160Q9Z0W3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Nup160Q9Z0W3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Nup160Q9Z0W3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Nup160Q9Z0W3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Nup160Q9Z0W3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Nup160Q9Z0W3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Nup160Q9Z0W3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Nup160Q9Z0W3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Nup160Q9Z0W3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Nup160Q9Z0W3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Nup160Q9Z0W3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Nup160Q9Z0W3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Nup160Q9Z0W3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Nup160Q9Z0W3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Nup160Q9Z0W3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Nup160Q9Z0W3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Nup160Q9Z0W3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
Nup160Q9Z0W3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Nup160Q9Z0W3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Nup160Q9Z0W3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Nup160Q9Z0W3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Nup160Q9Z0W3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Nup160Q9Z0W3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
Nup160Q9Z0W3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Nup160Q9Z0W3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Nup160Q9Z0W3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms