Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sema6cQ9WTM3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sema6cQ9WTM3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sema6cQ9WTM3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sema6cQ9WTM3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sema6cQ9WTM3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Sema6cQ9WTM3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sema6cQ9WTM3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sema6cQ9WTM3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sema6cQ9WTM3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sema6cQ9WTM3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sema6cQ9WTM3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Sema6cQ9WTM3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sema6cQ9WTM3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sema6cQ9WTM3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sema6cQ9WTM3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sema6cQ9WTM3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sema6cQ9WTM3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sema6cQ9WTM3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sema6cQ9WTM3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Sema6cQ9WTM3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sema6cQ9WTM3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sema6cQ9WTM3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sema6cQ9WTM3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sema6cQ9WTM3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sema6cQ9WTM3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sema6cQ9WTM3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sema6cQ9WTM3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Sema6cQ9WTM3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Sema6cQ9WTM3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Sema6cQ9WTM3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Sema6cQ9WTM3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sema6cQ9WTM3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sema6cQ9WTM3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sema6cQ9WTM3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sema6cQ9WTM3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sema6cQ9WTM3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sema6cQ9WTM3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sema6cQ9WTM3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sema6cQ9WTM3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sema6cQ9WTM3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sema6cQ9WTM3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sema6cQ9WTM3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sema6cQ9WTM3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sema6cQ9WTM3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sema6cQ9WTM3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sema6cQ9WTM3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sema6cQ9WTM3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sema6cQ9WTM3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Sema6cQ9WTM3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sema6cQ9WTM3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sema6cQ9WTM3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sema6cQ9WTM3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sema6cQ9WTM3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sema6cQ9WTM3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sema6cQ9WTM3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sema6cQ9WTM3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sema6cQ9WTM3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sema6cQ9WTM3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sema6cQ9WTM3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sema6cQ9WTM3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sema6cQ9WTM3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sema6cQ9WTM3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sema6cQ9WTM3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sema6cQ9WTM3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sema6cQ9WTM3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sema6cQ9WTM3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sema6cQ9WTM3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sema6cQ9WTM3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sema6cQ9WTM3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sema6cQ9WTM3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sema6cQ9WTM3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sema6cQ9WTM3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sema6cQ9WTM3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sema6cQ9WTM3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sema6cQ9WTM3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sema6cQ9WTM3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sema6cQ9WTM3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Sema6cQ9WTM3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sema6cQ9WTM3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Sema6cQ9WTM3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sema6cQ9WTM3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Sema6cQ9WTM3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sema6cQ9WTM3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sema6cQ9WTM3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sema6cQ9WTM3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sema6cQ9WTM3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sema6cQ9WTM3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sema6cQ9WTM3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sema6cQ9WTM3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sema6cQ9WTM3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sema6cQ9WTM3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sema6cQ9WTM3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sema6cQ9WTM3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sema6cQ9WTM3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sema6cQ9WTM3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sema6cQ9WTM3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sema6cQ9WTM3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Sema6cQ9WTM3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sema6cQ9WTM3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms