Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0W9

Chrna6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna6Q9R0W9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chrna6Q9R0W9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chrna6Q9R0W9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chrna6Q9R0W9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chrna6Q9R0W9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chrna6Q9R0W9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chrna6Q9R0W9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chrna6Q9R0W9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chrna6Q9R0W9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chrna6Q9R0W9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chrna6Q9R0W9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chrna6Q9R0W9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chrna6Q9R0W9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chrna6Q9R0W9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chrna6Q9R0W9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chrna6Q9R0W9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chrna6Q9R0W9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chrna6Q9R0W9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chrna6Q9R0W9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chrna6Q9R0W9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chrna6Q9R0W9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chrna6Q9R0W9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chrna6Q9R0W9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Chrna6Q9R0W9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chrna6Q9R0W9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Chrna6Q9R0W9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chrna6Q9R0W9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chrna6Q9R0W9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chrna6Q9R0W9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chrna6Q9R0W9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chrna6Q9R0W9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Chrna6Q9R0W9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chrna6Q9R0W9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chrna6Q9R0W9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chrna6Q9R0W9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chrna6Q9R0W9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chrna6Q9R0W9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chrna6Q9R0W9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chrna6Q9R0W9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chrna6Q9R0W9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chrna6Q9R0W9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chrna6Q9R0W9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chrna6Q9R0W9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chrna6Q9R0W9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chrna6Q9R0W9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Chrna6Q9R0W9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chrna6Q9R0W9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chrna6Q9R0W9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chrna6Q9R0W9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chrna6Q9R0W9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chrna6Q9R0W9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chrna6Q9R0W9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chrna6Q9R0W9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chrna6Q9R0W9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Chrna6Q9R0W9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chrna6Q9R0W9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chrna6Q9R0W9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chrna6Q9R0W9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chrna6Q9R0W9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chrna6Q9R0W9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chrna6Q9R0W9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chrna6Q9R0W9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chrna6Q9R0W9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chrna6Q9R0W9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chrna6Q9R0W9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Chrna6Q9R0W9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chrna6Q9R0W9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chrna6Q9R0W9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chrna6Q9R0W9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chrna6Q9R0W9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chrna6Q9R0W9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chrna6Q9R0W9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Chrna6Q9R0W9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Chrna6Q9R0W9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chrna6Q9R0W9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chrna6Q9R0W9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chrna6Q9R0W9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chrna6Q9R0W9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chrna6Q9R0W9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chrna6Q9R0W9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chrna6Q9R0W9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chrna6Q9R0W9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chrna6Q9R0W9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chrna6Q9R0W9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chrna6Q9R0W9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chrna6Q9R0W9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chrna6Q9R0W9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chrna6Q9R0W9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chrna6Q9R0W9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chrna6Q9R0W9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chrna6Q9R0W9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chrna6Q9R0W9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Chrna6Q9R0W9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chrna6Q9R0W9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chrna6Q9R0W9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chrna6Q9R0W9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Chrna6Q9R0W9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Chrna6Q9R0W9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chrna6Q9R0W9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chrna6Q9R0W9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms