Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYE3

Bcl11a, B-cell lymphoma/leukemia 11A, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11aQ9QYE3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Bcl11aQ9QYE3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Bcl11aQ9QYE3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Bcl11aQ9QYE3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Bcl11aQ9QYE3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Bcl11aQ9QYE3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Bcl11aQ9QYE3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Bcl11aQ9QYE3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Bcl11aQ9QYE3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Bcl11aQ9QYE3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Bcl11aQ9QYE3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Bcl11aQ9QYE3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Bcl11aQ9QYE3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Bcl11aQ9QYE3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Bcl11aQ9QYE3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Bcl11aQ9QYE3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Bcl11aQ9QYE3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Bcl11aQ9QYE3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Bcl11aQ9QYE3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Bcl11aQ9QYE3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Bcl11aQ9QYE3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Bcl11aQ9QYE3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Bcl11aQ9QYE3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Bcl11aQ9QYE3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Bcl11aQ9QYE3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Bcl11aQ9QYE3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Bcl11aQ9QYE3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Bcl11aQ9QYE3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Bcl11aQ9QYE3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Bcl11aQ9QYE3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Bcl11aQ9QYE3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Bcl11aQ9QYE3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Bcl11aQ9QYE3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Bcl11aQ9QYE3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Bcl11aQ9QYE3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Bcl11aQ9QYE3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Bcl11aQ9QYE3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Bcl11aQ9QYE3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Bcl11aQ9QYE3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Bcl11aQ9QYE3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Bcl11aQ9QYE3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Bcl11aQ9QYE3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Bcl11aQ9QYE3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Bcl11aQ9QYE3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Bcl11aQ9QYE3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Bcl11aQ9QYE3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Bcl11aQ9QYE3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Bcl11aQ9QYE3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Bcl11aQ9QYE3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Bcl11aQ9QYE3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Bcl11aQ9QYE3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Bcl11aQ9QYE3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Bcl11aQ9QYE3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Bcl11aQ9QYE3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Bcl11aQ9QYE3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Bcl11aQ9QYE3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Bcl11aQ9QYE3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
Bcl11aQ9QYE3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Bcl11aQ9QYE3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Bcl11aQ9QYE3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Bcl11aQ9QYE3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Bcl11aQ9QYE3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Bcl11aQ9QYE3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Bcl11aQ9QYE3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Bcl11aQ9QYE3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Bcl11aQ9QYE3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Bcl11aQ9QYE3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Bcl11aQ9QYE3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Bcl11aQ9QYE3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Bcl11aQ9QYE3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Bcl11aQ9QYE3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Bcl11aQ9QYE3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Bcl11aQ9QYE3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Bcl11aQ9QYE3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Bcl11aQ9QYE3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Bcl11aQ9QYE3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Bcl11aQ9QYE3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Bcl11aQ9QYE3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Bcl11aQ9QYE3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Bcl11aQ9QYE3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Bcl11aQ9QYE3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Bcl11aQ9QYE3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Bcl11aQ9QYE3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Bcl11aQ9QYE3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Bcl11aQ9QYE3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Bcl11aQ9QYE3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Bcl11aQ9QYE3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Bcl11aQ9QYE3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Bcl11aQ9QYE3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Bcl11aQ9QYE3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Bcl11aQ9QYE3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Bcl11aQ9QYE3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Bcl11aQ9QYE3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Bcl11aQ9QYE3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Bcl11aQ9QYE3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Bcl11aQ9QYE3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Bcl11aQ9QYE3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Bcl11aQ9QYE3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Bcl11aQ9QYE3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Bcl11aQ9QYE3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms