Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irx4Q9QY61 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irx4Q9QY61 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irx4Q9QY61 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irx4Q9QY61 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Irx4Q9QY61 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Irx4Q9QY61 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Irx4Q9QY61 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irx4Q9QY61 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irx4Q9QY61 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irx4Q9QY61 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irx4Q9QY61 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irx4Q9QY61 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irx4Q9QY61 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irx4Q9QY61 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irx4Q9QY61 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irx4Q9QY61 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irx4Q9QY61 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irx4Q9QY61 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irx4Q9QY61 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irx4Q9QY61 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Irx4Q9QY61 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Irx4Q9QY61 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Irx4Q9QY61 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Irx4Q9QY61 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Irx4Q9QY61 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Irx4Q9QY61 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Irx4Q9QY61 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irx4Q9QY61 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irx4Q9QY61 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irx4Q9QY61 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irx4Q9QY61 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irx4Q9QY61 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irx4Q9QY61 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irx4Q9QY61 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irx4Q9QY61 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irx4Q9QY61 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irx4Q9QY61 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irx4Q9QY61 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irx4Q9QY61 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Irx4Q9QY61 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Irx4Q9QY61 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Irx4Q9QY61 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Irx4Q9QY61 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Irx4Q9QY61 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Irx4Q9QY61 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Irx4Q9QY61 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Irx4Q9QY61 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Irx4Q9QY61 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Irx4Q9QY61 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Irx4Q9QY61 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Irx4Q9QY61 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Irx4Q9QY61 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Irx4Q9QY61 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Irx4Q9QY61 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Irx4Q9QY61 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Irx4Q9QY61 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Irx4Q9QY61 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Irx4Q9QY61 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Irx4Q9QY61 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Irx4Q9QY61 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Irx4Q9QY61 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Irx4Q9QY61 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Irx4Q9QY61 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Irx4Q9QY61 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Irx4Q9QY61 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Irx4Q9QY61 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Irx4Q9QY61 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Irx4Q9QY61 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irx4Q9QY61 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irx4Q9QY61 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irx4Q9QY61 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irx4Q9QY61 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irx4Q9QY61 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Irx4Q9QY61 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Irx4Q9QY61 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Irx4Q9QY61 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Irx4Q9QY61 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Irx4Q9QY61 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Irx4Q9QY61 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irx4Q9QY61 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irx4Q9QY61 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irx4Q9QY61 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Irx4Q9QY61 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irx4Q9QY61 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irx4Q9QY61 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irx4Q9QY61 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irx4Q9QY61 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irx4Q9QY61 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irx4Q9QY61 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irx4Q9QY61 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.95■■□□□ 1.27
Irx4Q9QY61 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Irx4Q9QY61 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Irx4Q9QY61 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Irx4Q9QY61 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Irx4Q9QY61 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irx4Q9QY61 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irx4Q9QY61 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irx4Q9QY61 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irx4Q9QY61 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms