Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMB0

Gkap1, G kinase-anchoring protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkap1Q9JMB0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gkap1Q9JMB0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gkap1Q9JMB0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gkap1Q9JMB0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gkap1Q9JMB0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gkap1Q9JMB0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Gkap1Q9JMB0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Gkap1Q9JMB0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gkap1Q9JMB0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gkap1Q9JMB0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gkap1Q9JMB0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gkap1Q9JMB0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gkap1Q9JMB0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gkap1Q9JMB0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gkap1Q9JMB0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gkap1Q9JMB0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gkap1Q9JMB0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gkap1Q9JMB0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gkap1Q9JMB0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gkap1Q9JMB0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gkap1Q9JMB0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gkap1Q9JMB0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gkap1Q9JMB0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gkap1Q9JMB0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gkap1Q9JMB0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gkap1Q9JMB0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gkap1Q9JMB0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gkap1Q9JMB0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gkap1Q9JMB0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gkap1Q9JMB0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gkap1Q9JMB0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gkap1Q9JMB0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gkap1Q9JMB0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gkap1Q9JMB0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gkap1Q9JMB0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gkap1Q9JMB0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gkap1Q9JMB0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gkap1Q9JMB0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gkap1Q9JMB0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gkap1Q9JMB0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gkap1Q9JMB0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gkap1Q9JMB0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gkap1Q9JMB0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gkap1Q9JMB0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gkap1Q9JMB0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gkap1Q9JMB0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gkap1Q9JMB0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gkap1Q9JMB0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gkap1Q9JMB0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gkap1Q9JMB0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gkap1Q9JMB0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gkap1Q9JMB0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gkap1Q9JMB0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gkap1Q9JMB0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gkap1Q9JMB0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gkap1Q9JMB0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gkap1Q9JMB0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gkap1Q9JMB0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gkap1Q9JMB0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gkap1Q9JMB0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gkap1Q9JMB0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gkap1Q9JMB0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gkap1Q9JMB0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gkap1Q9JMB0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gkap1Q9JMB0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gkap1Q9JMB0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gkap1Q9JMB0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gkap1Q9JMB0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gkap1Q9JMB0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gkap1Q9JMB0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gkap1Q9JMB0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gkap1Q9JMB0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gkap1Q9JMB0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gkap1Q9JMB0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gkap1Q9JMB0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gkap1Q9JMB0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Gkap1Q9JMB0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gkap1Q9JMB0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gkap1Q9JMB0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gkap1Q9JMB0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gkap1Q9JMB0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gkap1Q9JMB0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gkap1Q9JMB0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gkap1Q9JMB0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gkap1Q9JMB0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gkap1Q9JMB0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gkap1Q9JMB0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gkap1Q9JMB0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gkap1Q9JMB0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gkap1Q9JMB0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gkap1Q9JMB0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gkap1Q9JMB0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gkap1Q9JMB0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gkap1Q9JMB0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gkap1Q9JMB0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Gkap1Q9JMB0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gkap1Q9JMB0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gkap1Q9JMB0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gkap1Q9JMB0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Gkap1Q9JMB0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms