Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccl28Q9JIL2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccl28Q9JIL2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccl28Q9JIL2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccl28Q9JIL2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccl28Q9JIL2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccl28Q9JIL2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccl28Q9JIL2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccl28Q9JIL2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccl28Q9JIL2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccl28Q9JIL2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccl28Q9JIL2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccl28Q9JIL2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccl28Q9JIL2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccl28Q9JIL2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl28Q9JIL2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl28Q9JIL2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl28Q9JIL2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl28Q9JIL2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl28Q9JIL2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl28Q9JIL2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl28Q9JIL2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl28Q9JIL2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl28Q9JIL2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl28Q9JIL2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl28Q9JIL2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl28Q9JIL2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl28Q9JIL2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl28Q9JIL2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl28Q9JIL2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl28Q9JIL2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccl28Q9JIL2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccl28Q9JIL2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccl28Q9JIL2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccl28Q9JIL2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccl28Q9JIL2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccl28Q9JIL2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccl28Q9JIL2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccl28Q9JIL2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccl28Q9JIL2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl28Q9JIL2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl28Q9JIL2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl28Q9JIL2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl28Q9JIL2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl28Q9JIL2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl28Q9JIL2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl28Q9JIL2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl28Q9JIL2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl28Q9JIL2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl28Q9JIL2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl28Q9JIL2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl28Q9JIL2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl28Q9JIL2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl28Q9JIL2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl28Q9JIL2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl28Q9JIL2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl28Q9JIL2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl28Q9JIL2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl28Q9JIL2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl28Q9JIL2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl28Q9JIL2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl28Q9JIL2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl28Q9JIL2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccl28Q9JIL2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccl28Q9JIL2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccl28Q9JIL2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccl28Q9JIL2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccl28Q9JIL2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccl28Q9JIL2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccl28Q9JIL2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccl28Q9JIL2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccl28Q9JIL2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccl28Q9JIL2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccl28Q9JIL2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccl28Q9JIL2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccl28Q9JIL2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccl28Q9JIL2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccl28Q9JIL2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccl28Q9JIL2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccl28Q9JIL2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccl28Q9JIL2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccl28Q9JIL2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccl28Q9JIL2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccl28Q9JIL2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccl28Q9JIL2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccl28Q9JIL2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccl28Q9JIL2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccl28Q9JIL2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccl28Q9JIL2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccl28Q9JIL2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccl28Q9JIL2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccl28Q9JIL2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccl28Q9JIL2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccl28Q9JIL2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccl28Q9JIL2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccl28Q9JIL2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccl28Q9JIL2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccl28Q9JIL2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccl28Q9JIL2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccl28Q9JIL2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms