Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OtofQ9ESF1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OtofQ9ESF1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OtofQ9ESF1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OtofQ9ESF1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
OtofQ9ESF1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OtofQ9ESF1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OtofQ9ESF1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
OtofQ9ESF1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OtofQ9ESF1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OtofQ9ESF1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OtofQ9ESF1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OtofQ9ESF1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OtofQ9ESF1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OtofQ9ESF1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
OtofQ9ESF1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OtofQ9ESF1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OtofQ9ESF1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OtofQ9ESF1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OtofQ9ESF1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OtofQ9ESF1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
OtofQ9ESF1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OtofQ9ESF1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OtofQ9ESF1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OtofQ9ESF1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OtofQ9ESF1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OtofQ9ESF1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OtofQ9ESF1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
OtofQ9ESF1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
OtofQ9ESF1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
OtofQ9ESF1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OtofQ9ESF1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OtofQ9ESF1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OtofQ9ESF1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
OtofQ9ESF1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OtofQ9ESF1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OtofQ9ESF1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OtofQ9ESF1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OtofQ9ESF1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OtofQ9ESF1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OtofQ9ESF1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.31■■□□□ 1
OtofQ9ESF1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OtofQ9ESF1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OtofQ9ESF1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
OtofQ9ESF1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OtofQ9ESF1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OtofQ9ESF1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OtofQ9ESF1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OtofQ9ESF1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OtofQ9ESF1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OtofQ9ESF1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OtofQ9ESF1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
OtofQ9ESF1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OtofQ9ESF1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OtofQ9ESF1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
OtofQ9ESF1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OtofQ9ESF1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
OtofQ9ESF1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
OtofQ9ESF1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OtofQ9ESF1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OtofQ9ESF1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
OtofQ9ESF1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OtofQ9ESF1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OtofQ9ESF1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
OtofQ9ESF1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OtofQ9ESF1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OtofQ9ESF1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OtofQ9ESF1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
OtofQ9ESF1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.28■■□□□ 1
OtofQ9ESF1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
OtofQ9ESF1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OtofQ9ESF1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OtofQ9ESF1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OtofQ9ESF1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OtofQ9ESF1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.27■■□□□ 1
OtofQ9ESF1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OtofQ9ESF1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OtofQ9ESF1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
OtofQ9ESF1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OtofQ9ESF1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OtofQ9ESF1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OtofQ9ESF1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OtofQ9ESF1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OtofQ9ESF1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OtofQ9ESF1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OtofQ9ESF1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
OtofQ9ESF1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
OtofQ9ESF1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OtofQ9ESF1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
OtofQ9ESF1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
OtofQ9ESF1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
OtofQ9ESF1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OtofQ9ESF1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
OtofQ9ESF1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OtofQ9ESF1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OtofQ9ESF1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OtofQ9ESF1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OtofQ9ESF1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OtofQ9ESF1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
OtofQ9ESF1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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