Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERG2

Strn3, Striatin-3, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn3Q9ERG2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Strn3Q9ERG2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Strn3Q9ERG2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Strn3Q9ERG2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Strn3Q9ERG2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Strn3Q9ERG2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Strn3Q9ERG2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Strn3Q9ERG2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Strn3Q9ERG2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Strn3Q9ERG2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Strn3Q9ERG2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Strn3Q9ERG2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Strn3Q9ERG2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Strn3Q9ERG2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Strn3Q9ERG2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Strn3Q9ERG2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Strn3Q9ERG2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Strn3Q9ERG2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Strn3Q9ERG2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Strn3Q9ERG2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Strn3Q9ERG2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Strn3Q9ERG2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Strn3Q9ERG2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Strn3Q9ERG2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Strn3Q9ERG2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Strn3Q9ERG2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Strn3Q9ERG2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Strn3Q9ERG2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Strn3Q9ERG2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Strn3Q9ERG2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Strn3Q9ERG2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Strn3Q9ERG2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Strn3Q9ERG2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Strn3Q9ERG2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Strn3Q9ERG2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Strn3Q9ERG2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Strn3Q9ERG2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Strn3Q9ERG2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Strn3Q9ERG2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Strn3Q9ERG2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Strn3Q9ERG2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Strn3Q9ERG2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Strn3Q9ERG2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Strn3Q9ERG2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Strn3Q9ERG2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Strn3Q9ERG2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Strn3Q9ERG2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Strn3Q9ERG2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Strn3Q9ERG2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Strn3Q9ERG2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Strn3Q9ERG2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Strn3Q9ERG2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Strn3Q9ERG2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Strn3Q9ERG2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Strn3Q9ERG2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Strn3Q9ERG2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Strn3Q9ERG2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Strn3Q9ERG2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Strn3Q9ERG2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Strn3Q9ERG2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Strn3Q9ERG2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Strn3Q9ERG2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Strn3Q9ERG2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Strn3Q9ERG2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Strn3Q9ERG2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Strn3Q9ERG2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Strn3Q9ERG2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Strn3Q9ERG2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Strn3Q9ERG2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Strn3Q9ERG2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Strn3Q9ERG2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Strn3Q9ERG2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Strn3Q9ERG2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Strn3Q9ERG2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Strn3Q9ERG2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Strn3Q9ERG2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Strn3Q9ERG2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Strn3Q9ERG2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Strn3Q9ERG2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Strn3Q9ERG2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Strn3Q9ERG2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Strn3Q9ERG2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Strn3Q9ERG2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Strn3Q9ERG2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Strn3Q9ERG2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Strn3Q9ERG2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Strn3Q9ERG2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Strn3Q9ERG2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Strn3Q9ERG2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Strn3Q9ERG2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Strn3Q9ERG2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Strn3Q9ERG2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Strn3Q9ERG2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Strn3Q9ERG2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Strn3Q9ERG2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Strn3Q9ERG2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Strn3Q9ERG2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Strn3Q9ERG2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Strn3Q9ERG2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Strn3Q9ERG2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 215.1 ms