Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Irx6Q9ER75 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Irx6Q9ER75 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Irx6Q9ER75 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Irx6Q9ER75 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Irx6Q9ER75 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Irx6Q9ER75 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Irx6Q9ER75 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Irx6Q9ER75 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Irx6Q9ER75 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Irx6Q9ER75 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Irx6Q9ER75 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Irx6Q9ER75 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Irx6Q9ER75 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Irx6Q9ER75 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Irx6Q9ER75 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Irx6Q9ER75 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Irx6Q9ER75 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Irx6Q9ER75 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Irx6Q9ER75 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Irx6Q9ER75 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Irx6Q9ER75 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Irx6Q9ER75 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Irx6Q9ER75 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Irx6Q9ER75 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Irx6Q9ER75 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Irx6Q9ER75 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Irx6Q9ER75 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Irx6Q9ER75 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Irx6Q9ER75 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Irx6Q9ER75 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Irx6Q9ER75 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Irx6Q9ER75 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Irx6Q9ER75 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Irx6Q9ER75 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Irx6Q9ER75 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Irx6Q9ER75 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Irx6Q9ER75 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Irx6Q9ER75 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Irx6Q9ER75 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Irx6Q9ER75 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Irx6Q9ER75 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Irx6Q9ER75 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Irx6Q9ER75 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Irx6Q9ER75 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Irx6Q9ER75 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Irx6Q9ER75 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Irx6Q9ER75 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Irx6Q9ER75 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Irx6Q9ER75 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Irx6Q9ER75 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Irx6Q9ER75 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Irx6Q9ER75 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Irx6Q9ER75 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Irx6Q9ER75 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Irx6Q9ER75 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Irx6Q9ER75 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Irx6Q9ER75 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Irx6Q9ER75 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Irx6Q9ER75 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Irx6Q9ER75 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Irx6Q9ER75 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Irx6Q9ER75 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Irx6Q9ER75 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Irx6Q9ER75 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Irx6Q9ER75 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Irx6Q9ER75 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Irx6Q9ER75 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Irx6Q9ER75 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Irx6Q9ER75 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Irx6Q9ER75 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Irx6Q9ER75 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Irx6Q9ER75 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Irx6Q9ER75 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Irx6Q9ER75 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Irx6Q9ER75 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Irx6Q9ER75 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Irx6Q9ER75 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Irx6Q9ER75 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Irx6Q9ER75 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Irx6Q9ER75 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Irx6Q9ER75 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Irx6Q9ER75 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Irx6Q9ER75 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Irx6Q9ER75 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Irx6Q9ER75 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Irx6Q9ER75 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Irx6Q9ER75 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Irx6Q9ER75 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Irx6Q9ER75 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Irx6Q9ER75 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Irx6Q9ER75 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Irx6Q9ER75 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Irx6Q9ER75 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Irx6Q9ER75 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Irx6Q9ER75 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Irx6Q9ER75 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Irx6Q9ER75 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Irx6Q9ER75 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Irx6Q9ER75 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms