Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stx12Q9ER00 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stx12Q9ER00 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stx12Q9ER00 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stx12Q9ER00 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stx12Q9ER00 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stx12Q9ER00 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stx12Q9ER00 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stx12Q9ER00 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stx12Q9ER00 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Stx12Q9ER00 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Stx12Q9ER00 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Stx12Q9ER00 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Stx12Q9ER00 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Stx12Q9ER00 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Stx12Q9ER00 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Stx12Q9ER00 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Stx12Q9ER00 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Stx12Q9ER00 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stx12Q9ER00 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stx12Q9ER00 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stx12Q9ER00 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stx12Q9ER00 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stx12Q9ER00 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stx12Q9ER00 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stx12Q9ER00 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stx12Q9ER00 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stx12Q9ER00 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stx12Q9ER00 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stx12Q9ER00 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stx12Q9ER00 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stx12Q9ER00 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stx12Q9ER00 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stx12Q9ER00 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stx12Q9ER00 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stx12Q9ER00 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stx12Q9ER00 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stx12Q9ER00 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Stx12Q9ER00 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stx12Q9ER00 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Stx12Q9ER00 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stx12Q9ER00 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stx12Q9ER00 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Stx12Q9ER00 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stx12Q9ER00 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx12Q9ER00 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx12Q9ER00 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx12Q9ER00 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx12Q9ER00 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx12Q9ER00 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx12Q9ER00 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx12Q9ER00 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx12Q9ER00 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx12Q9ER00 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx12Q9ER00 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx12Q9ER00 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx12Q9ER00 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx12Q9ER00 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx12Q9ER00 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx12Q9ER00 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx12Q9ER00 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx12Q9ER00 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx12Q9ER00 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx12Q9ER00 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx12Q9ER00 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx12Q9ER00 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx12Q9ER00 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx12Q9ER00 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx12Q9ER00 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx12Q9ER00 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx12Q9ER00 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx12Q9ER00 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx12Q9ER00 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx12Q9ER00 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Stx12Q9ER00 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx12Q9ER00 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx12Q9ER00 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx12Q9ER00 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx12Q9ER00 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx12Q9ER00 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx12Q9ER00 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx12Q9ER00 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx12Q9ER00 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx12Q9ER00 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx12Q9ER00 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx12Q9ER00 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx12Q9ER00 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx12Q9ER00 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx12Q9ER00 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stx12Q9ER00 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stx12Q9ER00 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stx12Q9ER00 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stx12Q9ER00 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Stx12Q9ER00 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stx12Q9ER00 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stx12Q9ER00 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stx12Q9ER00 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stx12Q9ER00 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stx12Q9ER00 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stx12Q9ER00 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms