Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP51

Vmn1r50, Vomeronasal type-1 receptor 50, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r50Q9EP51 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r50Q9EP51 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r50Q9EP51 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r50Q9EP51 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r50Q9EP51 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r50Q9EP51 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r50Q9EP51 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r50Q9EP51 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r50Q9EP51 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r50Q9EP51 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r50Q9EP51 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r50Q9EP51 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r50Q9EP51 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r50Q9EP51 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r50Q9EP51 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r50Q9EP51 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r50Q9EP51 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r50Q9EP51 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r50Q9EP51 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r50Q9EP51 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r50Q9EP51 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r50Q9EP51 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r50Q9EP51 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r50Q9EP51 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r50Q9EP51 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r50Q9EP51 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r50Q9EP51 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r50Q9EP51 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r50Q9EP51 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r50Q9EP51 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r50Q9EP51 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r50Q9EP51 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r50Q9EP51 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r50Q9EP51 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r50Q9EP51 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r50Q9EP51 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r50Q9EP51 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r50Q9EP51 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r50Q9EP51 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r50Q9EP51 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r50Q9EP51 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Vmn1r50Q9EP51 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r50Q9EP51 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r50Q9EP51 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r50Q9EP51 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r50Q9EP51 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r50Q9EP51 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r50Q9EP51 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r50Q9EP51 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r50Q9EP51 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r50Q9EP51 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r50Q9EP51 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r50Q9EP51 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r50Q9EP51 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r50Q9EP51 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r50Q9EP51 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r50Q9EP51 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r50Q9EP51 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r50Q9EP51 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r50Q9EP51 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r50Q9EP51 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r50Q9EP51 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r50Q9EP51 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r50Q9EP51 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r50Q9EP51 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r50Q9EP51 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r50Q9EP51 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r50Q9EP51 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r50Q9EP51 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r50Q9EP51 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r50Q9EP51 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r50Q9EP51 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r50Q9EP51 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r50Q9EP51 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r50Q9EP51 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r50Q9EP51 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r50Q9EP51 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r50Q9EP51 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r50Q9EP51 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r50Q9EP51 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r50Q9EP51 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r50Q9EP51 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r50Q9EP51 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r50Q9EP51 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r50Q9EP51 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r50Q9EP51 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r50Q9EP51 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r50Q9EP51 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r50Q9EP51 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r50Q9EP51 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r50Q9EP51 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r50Q9EP51 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r50Q9EP51 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r50Q9EP51 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r50Q9EP51 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r50Q9EP51 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vmn1r50Q9EP51 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vmn1r50Q9EP51 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r50Q9EP51 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r50Q9EP51 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms