Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCE5

Pak1ip1, p21-activated protein kinase-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pak1ip1Q9DCE5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pak1ip1Q9DCE5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pak1ip1Q9DCE5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pak1ip1Q9DCE5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pak1ip1Q9DCE5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pak1ip1Q9DCE5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Pak1ip1Q9DCE5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pak1ip1Q9DCE5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pak1ip1Q9DCE5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pak1ip1Q9DCE5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pak1ip1Q9DCE5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pak1ip1Q9DCE5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pak1ip1Q9DCE5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pak1ip1Q9DCE5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pak1ip1Q9DCE5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pak1ip1Q9DCE5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pak1ip1Q9DCE5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pak1ip1Q9DCE5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pak1ip1Q9DCE5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pak1ip1Q9DCE5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pak1ip1Q9DCE5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pak1ip1Q9DCE5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pak1ip1Q9DCE5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pak1ip1Q9DCE5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pak1ip1Q9DCE5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pak1ip1Q9DCE5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pak1ip1Q9DCE5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pak1ip1Q9DCE5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pak1ip1Q9DCE5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pak1ip1Q9DCE5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pak1ip1Q9DCE5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pak1ip1Q9DCE5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pak1ip1Q9DCE5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pak1ip1Q9DCE5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pak1ip1Q9DCE5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pak1ip1Q9DCE5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pak1ip1Q9DCE5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pak1ip1Q9DCE5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pak1ip1Q9DCE5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pak1ip1Q9DCE5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pak1ip1Q9DCE5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pak1ip1Q9DCE5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pak1ip1Q9DCE5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pak1ip1Q9DCE5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pak1ip1Q9DCE5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pak1ip1Q9DCE5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pak1ip1Q9DCE5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pak1ip1Q9DCE5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pak1ip1Q9DCE5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pak1ip1Q9DCE5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pak1ip1Q9DCE5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pak1ip1Q9DCE5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pak1ip1Q9DCE5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pak1ip1Q9DCE5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pak1ip1Q9DCE5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pak1ip1Q9DCE5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pak1ip1Q9DCE5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pak1ip1Q9DCE5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pak1ip1Q9DCE5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pak1ip1Q9DCE5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pak1ip1Q9DCE5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pak1ip1Q9DCE5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pak1ip1Q9DCE5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pak1ip1Q9DCE5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pak1ip1Q9DCE5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pak1ip1Q9DCE5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pak1ip1Q9DCE5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pak1ip1Q9DCE5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pak1ip1Q9DCE5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pak1ip1Q9DCE5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pak1ip1Q9DCE5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pak1ip1Q9DCE5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pak1ip1Q9DCE5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pak1ip1Q9DCE5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pak1ip1Q9DCE5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pak1ip1Q9DCE5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pak1ip1Q9DCE5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pak1ip1Q9DCE5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pak1ip1Q9DCE5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pak1ip1Q9DCE5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pak1ip1Q9DCE5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pak1ip1Q9DCE5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pak1ip1Q9DCE5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pak1ip1Q9DCE5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pak1ip1Q9DCE5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pak1ip1Q9DCE5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Pak1ip1Q9DCE5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pak1ip1Q9DCE5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pak1ip1Q9DCE5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pak1ip1Q9DCE5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pak1ip1Q9DCE5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pak1ip1Q9DCE5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pak1ip1Q9DCE5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pak1ip1Q9DCE5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pak1ip1Q9DCE5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pak1ip1Q9DCE5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pak1ip1Q9DCE5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pak1ip1Q9DCE5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pak1ip1Q9DCE5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pak1ip1Q9DCE5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms