Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SrpraQ9DBG7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SrpraQ9DBG7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SrpraQ9DBG7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SrpraQ9DBG7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SrpraQ9DBG7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SrpraQ9DBG7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SrpraQ9DBG7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SrpraQ9DBG7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SrpraQ9DBG7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SrpraQ9DBG7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SrpraQ9DBG7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SrpraQ9DBG7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SrpraQ9DBG7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SrpraQ9DBG7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SrpraQ9DBG7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SrpraQ9DBG7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SrpraQ9DBG7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SrpraQ9DBG7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SrpraQ9DBG7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SrpraQ9DBG7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SrpraQ9DBG7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SrpraQ9DBG7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SrpraQ9DBG7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SrpraQ9DBG7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SrpraQ9DBG7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SrpraQ9DBG7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SrpraQ9DBG7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SrpraQ9DBG7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SrpraQ9DBG7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SrpraQ9DBG7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SrpraQ9DBG7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SrpraQ9DBG7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SrpraQ9DBG7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SrpraQ9DBG7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SrpraQ9DBG7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SrpraQ9DBG7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SrpraQ9DBG7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SrpraQ9DBG7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SrpraQ9DBG7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SrpraQ9DBG7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SrpraQ9DBG7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SrpraQ9DBG7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SrpraQ9DBG7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SrpraQ9DBG7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SrpraQ9DBG7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SrpraQ9DBG7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SrpraQ9DBG7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SrpraQ9DBG7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SrpraQ9DBG7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SrpraQ9DBG7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SrpraQ9DBG7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SrpraQ9DBG7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SrpraQ9DBG7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SrpraQ9DBG7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SrpraQ9DBG7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SrpraQ9DBG7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SrpraQ9DBG7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SrpraQ9DBG7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SrpraQ9DBG7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SrpraQ9DBG7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SrpraQ9DBG7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SrpraQ9DBG7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SrpraQ9DBG7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SrpraQ9DBG7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SrpraQ9DBG7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SrpraQ9DBG7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SrpraQ9DBG7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SrpraQ9DBG7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SrpraQ9DBG7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SrpraQ9DBG7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SrpraQ9DBG7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SrpraQ9DBG7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SrpraQ9DBG7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SrpraQ9DBG7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SrpraQ9DBG7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SrpraQ9DBG7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SrpraQ9DBG7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SrpraQ9DBG7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SrpraQ9DBG7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SrpraQ9DBG7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SrpraQ9DBG7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SrpraQ9DBG7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SrpraQ9DBG7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SrpraQ9DBG7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SrpraQ9DBG7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SrpraQ9DBG7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SrpraQ9DBG7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SrpraQ9DBG7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SrpraQ9DBG7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SrpraQ9DBG7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SrpraQ9DBG7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SrpraQ9DBG7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SrpraQ9DBG7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SrpraQ9DBG7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SrpraQ9DBG7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SrpraQ9DBG7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SrpraQ9DBG7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SrpraQ9DBG7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SrpraQ9DBG7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms