Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW6

Prpf4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4Q9DAW6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpf4Q9DAW6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpf4Q9DAW6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpf4Q9DAW6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpf4Q9DAW6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpf4Q9DAW6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpf4Q9DAW6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpf4Q9DAW6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpf4Q9DAW6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf4Q9DAW6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf4Q9DAW6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf4Q9DAW6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf4Q9DAW6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpf4Q9DAW6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpf4Q9DAW6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpf4Q9DAW6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpf4Q9DAW6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpf4Q9DAW6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpf4Q9DAW6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpf4Q9DAW6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpf4Q9DAW6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Prpf4Q9DAW6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpf4Q9DAW6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpf4Q9DAW6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpf4Q9DAW6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpf4Q9DAW6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpf4Q9DAW6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpf4Q9DAW6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpf4Q9DAW6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpf4Q9DAW6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpf4Q9DAW6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpf4Q9DAW6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Prpf4Q9DAW6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prpf4Q9DAW6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prpf4Q9DAW6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prpf4Q9DAW6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prpf4Q9DAW6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prpf4Q9DAW6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prpf4Q9DAW6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prpf4Q9DAW6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prpf4Q9DAW6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prpf4Q9DAW6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prpf4Q9DAW6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prpf4Q9DAW6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpf4Q9DAW6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpf4Q9DAW6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpf4Q9DAW6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpf4Q9DAW6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpf4Q9DAW6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpf4Q9DAW6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpf4Q9DAW6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpf4Q9DAW6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpf4Q9DAW6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpf4Q9DAW6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpf4Q9DAW6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpf4Q9DAW6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpf4Q9DAW6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpf4Q9DAW6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
Prpf4Q9DAW6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prpf4Q9DAW6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prpf4Q9DAW6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prpf4Q9DAW6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prpf4Q9DAW6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prpf4Q9DAW6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prpf4Q9DAW6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prpf4Q9DAW6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prpf4Q9DAW6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prpf4Q9DAW6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prpf4Q9DAW6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prpf4Q9DAW6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prpf4Q9DAW6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prpf4Q9DAW6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prpf4Q9DAW6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prpf4Q9DAW6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prpf4Q9DAW6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prpf4Q9DAW6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prpf4Q9DAW6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prpf4Q9DAW6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prpf4Q9DAW6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Prpf4Q9DAW6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prpf4Q9DAW6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prpf4Q9DAW6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prpf4Q9DAW6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prpf4Q9DAW6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prpf4Q9DAW6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prpf4Q9DAW6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prpf4Q9DAW6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prpf4Q9DAW6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prpf4Q9DAW6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prpf4Q9DAW6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prpf4Q9DAW6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prpf4Q9DAW6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prpf4Q9DAW6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prpf4Q9DAW6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prpf4Q9DAW6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prpf4Q9DAW6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prpf4Q9DAW6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prpf4Q9DAW6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Prpf4Q9DAW6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prpf4Q9DAW6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms