Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Subh2bvQ9D9Z7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Subh2bvQ9D9Z7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Subh2bvQ9D9Z7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Subh2bvQ9D9Z7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Subh2bvQ9D9Z7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Subh2bvQ9D9Z7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Subh2bvQ9D9Z7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Subh2bvQ9D9Z7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Subh2bvQ9D9Z7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Subh2bvQ9D9Z7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Subh2bvQ9D9Z7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Subh2bvQ9D9Z7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Subh2bvQ9D9Z7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Subh2bvQ9D9Z7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Subh2bvQ9D9Z7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Subh2bvQ9D9Z7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Subh2bvQ9D9Z7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Subh2bvQ9D9Z7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Subh2bvQ9D9Z7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Subh2bvQ9D9Z7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Subh2bvQ9D9Z7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Subh2bvQ9D9Z7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Subh2bvQ9D9Z7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Subh2bvQ9D9Z7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Subh2bvQ9D9Z7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Subh2bvQ9D9Z7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Subh2bvQ9D9Z7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Subh2bvQ9D9Z7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Subh2bvQ9D9Z7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Subh2bvQ9D9Z7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Subh2bvQ9D9Z7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Subh2bvQ9D9Z7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Subh2bvQ9D9Z7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Subh2bvQ9D9Z7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Subh2bvQ9D9Z7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Subh2bvQ9D9Z7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Subh2bvQ9D9Z7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Subh2bvQ9D9Z7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Subh2bvQ9D9Z7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Subh2bvQ9D9Z7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Subh2bvQ9D9Z7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Subh2bvQ9D9Z7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Subh2bvQ9D9Z7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Subh2bvQ9D9Z7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Subh2bvQ9D9Z7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Subh2bvQ9D9Z7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Subh2bvQ9D9Z7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Subh2bvQ9D9Z7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Subh2bvQ9D9Z7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Subh2bvQ9D9Z7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Subh2bvQ9D9Z7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Subh2bvQ9D9Z7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Subh2bvQ9D9Z7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Subh2bvQ9D9Z7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Subh2bvQ9D9Z7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Subh2bvQ9D9Z7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Subh2bvQ9D9Z7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Subh2bvQ9D9Z7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Subh2bvQ9D9Z7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Subh2bvQ9D9Z7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Subh2bvQ9D9Z7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Subh2bvQ9D9Z7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Subh2bvQ9D9Z7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Subh2bvQ9D9Z7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Subh2bvQ9D9Z7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Subh2bvQ9D9Z7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Subh2bvQ9D9Z7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Subh2bvQ9D9Z7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Subh2bvQ9D9Z7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Subh2bvQ9D9Z7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Subh2bvQ9D9Z7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Subh2bvQ9D9Z7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Subh2bvQ9D9Z7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Subh2bvQ9D9Z7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Subh2bvQ9D9Z7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Subh2bvQ9D9Z7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Subh2bvQ9D9Z7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Subh2bvQ9D9Z7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Subh2bvQ9D9Z7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Subh2bvQ9D9Z7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Subh2bvQ9D9Z7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Subh2bvQ9D9Z7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Subh2bvQ9D9Z7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Subh2bvQ9D9Z7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Subh2bvQ9D9Z7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Subh2bvQ9D9Z7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Subh2bvQ9D9Z7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Subh2bvQ9D9Z7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Subh2bvQ9D9Z7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Subh2bvQ9D9Z7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Subh2bvQ9D9Z7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Subh2bvQ9D9Z7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Subh2bvQ9D9Z7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Subh2bvQ9D9Z7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Subh2bvQ9D9Z7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Subh2bvQ9D9Z7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Subh2bvQ9D9Z7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Subh2bvQ9D9Z7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms