Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cldn34b2Q9D9N2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cldn34b2Q9D9N2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cldn34b2Q9D9N2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Cldn34b2Q9D9N2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cldn34b2Q9D9N2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cldn34b2Q9D9N2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cldn34b2Q9D9N2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cldn34b2Q9D9N2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Cldn34b2Q9D9N2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cldn34b2Q9D9N2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cldn34b2Q9D9N2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Cldn34b2Q9D9N2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cldn34b2Q9D9N2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cldn34b2Q9D9N2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Cldn34b2Q9D9N2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cldn34b2Q9D9N2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cldn34b2Q9D9N2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cldn34b2Q9D9N2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cldn34b2Q9D9N2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cldn34b2Q9D9N2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cldn34b2Q9D9N2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cldn34b2Q9D9N2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cldn34b2Q9D9N2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cldn34b2Q9D9N2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cldn34b2Q9D9N2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cldn34b2Q9D9N2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cldn34b2Q9D9N2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cldn34b2Q9D9N2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cldn34b2Q9D9N2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cldn34b2Q9D9N2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cldn34b2Q9D9N2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cldn34b2Q9D9N2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cldn34b2Q9D9N2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cldn34b2Q9D9N2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Cldn34b2Q9D9N2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Cldn34b2Q9D9N2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cldn34b2Q9D9N2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Cldn34b2Q9D9N2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cldn34b2Q9D9N2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cldn34b2Q9D9N2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cldn34b2Q9D9N2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cldn34b2Q9D9N2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cldn34b2Q9D9N2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cldn34b2Q9D9N2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cldn34b2Q9D9N2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cldn34b2Q9D9N2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cldn34b2Q9D9N2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cldn34b2Q9D9N2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cldn34b2Q9D9N2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cldn34b2Q9D9N2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cldn34b2Q9D9N2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cldn34b2Q9D9N2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Cldn34b2Q9D9N2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cldn34b2Q9D9N2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cldn34b2Q9D9N2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cldn34b2Q9D9N2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cldn34b2Q9D9N2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cldn34b2Q9D9N2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cldn34b2Q9D9N2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cldn34b2Q9D9N2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Cldn34b2Q9D9N2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Cldn34b2Q9D9N2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cldn34b2Q9D9N2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cldn34b2Q9D9N2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cldn34b2Q9D9N2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cldn34b2Q9D9N2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cldn34b2Q9D9N2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cldn34b2Q9D9N2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cldn34b2Q9D9N2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cldn34b2Q9D9N2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cldn34b2Q9D9N2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cldn34b2Q9D9N2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cldn34b2Q9D9N2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cldn34b2Q9D9N2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cldn34b2Q9D9N2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cldn34b2Q9D9N2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cldn34b2Q9D9N2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Cldn34b2Q9D9N2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Cldn34b2Q9D9N2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cldn34b2Q9D9N2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cldn34b2Q9D9N2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cldn34b2Q9D9N2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cldn34b2Q9D9N2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cldn34b2Q9D9N2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cldn34b2Q9D9N2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cldn34b2Q9D9N2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Cldn34b2Q9D9N2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cldn34b2Q9D9N2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cldn34b2Q9D9N2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Cldn34b2Q9D9N2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cldn34b2Q9D9N2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cldn34b2Q9D9N2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cldn34b2Q9D9N2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cldn34b2Q9D9N2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cldn34b2Q9D9N2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cldn34b2Q9D9N2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
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