Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L0

Uncharacterized protein C11orf52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8L0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D8L0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D8L0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D8L0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D8L0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D8L0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D8L0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D8L0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D8L0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D8L0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D8L0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D8L0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D8L0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D8L0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D8L0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D8L0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D8L0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D8L0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q9D8L0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q9D8L0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q9D8L0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D8L0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D8L0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D8L0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D8L0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D8L0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D8L0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D8L0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D8L0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D8L0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D8L0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D8L0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D8L0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D8L0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D8L0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D8L0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D8L0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D8L0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D8L0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D8L0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D8L0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D8L0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D8L0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D8L0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D8L0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D8L0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D8L0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D8L0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D8L0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D8L0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D8L0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D8L0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D8L0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D8L0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D8L0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D8L0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D8L0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D8L0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D8L0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D8L0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D8L0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D8L0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D8L0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D8L0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D8L0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D8L0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D8L0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D8L0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D8L0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D8L0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D8L0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D8L0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D8L0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D8L0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D8L0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D8L0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D8L0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D8L0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D8L0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D8L0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Q9D8L0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D8L0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D8L0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D8L0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D8L0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D8L0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D8L0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D8L0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D8L0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D8L0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D8L0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D8L0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D8L0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D8L0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D8L0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D8L0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D8L0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D8L0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D8L0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D8L0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms