Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Y9

Slx4ip, Protein SLX4IP, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4ipQ9D7Y9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slx4ipQ9D7Y9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slx4ipQ9D7Y9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slx4ipQ9D7Y9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slx4ipQ9D7Y9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slx4ipQ9D7Y9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slx4ipQ9D7Y9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slx4ipQ9D7Y9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slx4ipQ9D7Y9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slx4ipQ9D7Y9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slx4ipQ9D7Y9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slx4ipQ9D7Y9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slx4ipQ9D7Y9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Slx4ipQ9D7Y9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slx4ipQ9D7Y9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slx4ipQ9D7Y9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slx4ipQ9D7Y9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slx4ipQ9D7Y9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slx4ipQ9D7Y9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slx4ipQ9D7Y9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slx4ipQ9D7Y9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slx4ipQ9D7Y9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slx4ipQ9D7Y9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slx4ipQ9D7Y9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slx4ipQ9D7Y9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slx4ipQ9D7Y9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Slx4ipQ9D7Y9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Slx4ipQ9D7Y9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Slx4ipQ9D7Y9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Slx4ipQ9D7Y9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Slx4ipQ9D7Y9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Slx4ipQ9D7Y9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Slx4ipQ9D7Y9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Slx4ipQ9D7Y9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Slx4ipQ9D7Y9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Slx4ipQ9D7Y9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Slx4ipQ9D7Y9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Slx4ipQ9D7Y9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Slx4ipQ9D7Y9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Slx4ipQ9D7Y9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Slx4ipQ9D7Y9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Slx4ipQ9D7Y9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slx4ipQ9D7Y9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slx4ipQ9D7Y9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slx4ipQ9D7Y9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slx4ipQ9D7Y9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slx4ipQ9D7Y9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slx4ipQ9D7Y9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slx4ipQ9D7Y9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slx4ipQ9D7Y9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slx4ipQ9D7Y9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slx4ipQ9D7Y9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slx4ipQ9D7Y9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slx4ipQ9D7Y9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slx4ipQ9D7Y9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slx4ipQ9D7Y9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slx4ipQ9D7Y9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slx4ipQ9D7Y9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slx4ipQ9D7Y9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slx4ipQ9D7Y9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slx4ipQ9D7Y9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slx4ipQ9D7Y9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Slx4ipQ9D7Y9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slx4ipQ9D7Y9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slx4ipQ9D7Y9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slx4ipQ9D7Y9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slx4ipQ9D7Y9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slx4ipQ9D7Y9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slx4ipQ9D7Y9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slx4ipQ9D7Y9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slx4ipQ9D7Y9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Slx4ipQ9D7Y9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slx4ipQ9D7Y9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slx4ipQ9D7Y9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slx4ipQ9D7Y9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slx4ipQ9D7Y9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slx4ipQ9D7Y9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slx4ipQ9D7Y9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slx4ipQ9D7Y9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slx4ipQ9D7Y9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slx4ipQ9D7Y9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slx4ipQ9D7Y9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slx4ipQ9D7Y9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slx4ipQ9D7Y9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slx4ipQ9D7Y9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Slx4ipQ9D7Y9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slx4ipQ9D7Y9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slx4ipQ9D7Y9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slx4ipQ9D7Y9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slx4ipQ9D7Y9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slx4ipQ9D7Y9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slx4ipQ9D7Y9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slx4ipQ9D7Y9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slx4ipQ9D7Y9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slx4ipQ9D7Y9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slx4ipQ9D7Y9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms