Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S0

Lypd8, Ly6/PLAUR domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lypd8Q9D7S0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lypd8Q9D7S0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lypd8Q9D7S0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lypd8Q9D7S0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Lypd8Q9D7S0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lypd8Q9D7S0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lypd8Q9D7S0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lypd8Q9D7S0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lypd8Q9D7S0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lypd8Q9D7S0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lypd8Q9D7S0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lypd8Q9D7S0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lypd8Q9D7S0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lypd8Q9D7S0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lypd8Q9D7S0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Lypd8Q9D7S0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lypd8Q9D7S0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lypd8Q9D7S0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lypd8Q9D7S0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lypd8Q9D7S0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lypd8Q9D7S0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lypd8Q9D7S0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lypd8Q9D7S0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lypd8Q9D7S0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lypd8Q9D7S0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lypd8Q9D7S0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lypd8Q9D7S0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lypd8Q9D7S0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lypd8Q9D7S0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lypd8Q9D7S0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Lypd8Q9D7S0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lypd8Q9D7S0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lypd8Q9D7S0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lypd8Q9D7S0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lypd8Q9D7S0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lypd8Q9D7S0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lypd8Q9D7S0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lypd8Q9D7S0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lypd8Q9D7S0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lypd8Q9D7S0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lypd8Q9D7S0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lypd8Q9D7S0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lypd8Q9D7S0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lypd8Q9D7S0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lypd8Q9D7S0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lypd8Q9D7S0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lypd8Q9D7S0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lypd8Q9D7S0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lypd8Q9D7S0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lypd8Q9D7S0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lypd8Q9D7S0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lypd8Q9D7S0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lypd8Q9D7S0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lypd8Q9D7S0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lypd8Q9D7S0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lypd8Q9D7S0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lypd8Q9D7S0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lypd8Q9D7S0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lypd8Q9D7S0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lypd8Q9D7S0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lypd8Q9D7S0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lypd8Q9D7S0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lypd8Q9D7S0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lypd8Q9D7S0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lypd8Q9D7S0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lypd8Q9D7S0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lypd8Q9D7S0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Lypd8Q9D7S0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lypd8Q9D7S0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lypd8Q9D7S0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lypd8Q9D7S0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lypd8Q9D7S0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Lypd8Q9D7S0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lypd8Q9D7S0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lypd8Q9D7S0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lypd8Q9D7S0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lypd8Q9D7S0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lypd8Q9D7S0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lypd8Q9D7S0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lypd8Q9D7S0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lypd8Q9D7S0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Lypd8Q9D7S0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lypd8Q9D7S0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Lypd8Q9D7S0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lypd8Q9D7S0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lypd8Q9D7S0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lypd8Q9D7S0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lypd8Q9D7S0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lypd8Q9D7S0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lypd8Q9D7S0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lypd8Q9D7S0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lypd8Q9D7S0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lypd8Q9D7S0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lypd8Q9D7S0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lypd8Q9D7S0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lypd8Q9D7S0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lypd8Q9D7S0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lypd8Q9D7S0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lypd8Q9D7S0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lypd8Q9D7S0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.4 ms