Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D7E4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D7E4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D7E4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D7E4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9D7E4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9D7E4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9D7E4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9D7E4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9D7E4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9D7E4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9D7E4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9D7E4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9D7E4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D7E4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D7E4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D7E4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D7E4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D7E4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D7E4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D7E4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D7E4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D7E4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D7E4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D7E4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D7E4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D7E4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D7E4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D7E4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D7E4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D7E4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D7E4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D7E4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D7E4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D7E4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D7E4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D7E4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D7E4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D7E4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D7E4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D7E4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D7E4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D7E4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D7E4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D7E4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D7E4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D7E4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D7E4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D7E4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D7E4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D7E4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D7E4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D7E4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D7E4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D7E4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D7E4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D7E4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D7E4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D7E4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D7E4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D7E4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D7E4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D7E4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D7E4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D7E4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D7E4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D7E4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D7E4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D7E4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D7E4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D7E4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D7E4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D7E4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D7E4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D7E4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D7E4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q9D7E4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q9D7E4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q9D7E4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D7E4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D7E4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D7E4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D7E4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D7E4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D7E4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D7E4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D7E4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D7E4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D7E4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D7E4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D7E4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D7E4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D7E4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D7E4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D7E4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D7E4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D7E4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D7E4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D7E4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D7E4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms