Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D1

Rnf225, RING finger protein 225, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf225Q9D7D1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf225Q9D7D1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf225Q9D7D1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf225Q9D7D1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf225Q9D7D1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf225Q9D7D1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf225Q9D7D1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf225Q9D7D1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf225Q9D7D1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf225Q9D7D1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf225Q9D7D1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf225Q9D7D1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf225Q9D7D1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf225Q9D7D1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf225Q9D7D1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf225Q9D7D1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf225Q9D7D1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf225Q9D7D1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf225Q9D7D1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf225Q9D7D1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf225Q9D7D1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf225Q9D7D1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf225Q9D7D1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf225Q9D7D1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf225Q9D7D1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf225Q9D7D1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf225Q9D7D1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf225Q9D7D1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf225Q9D7D1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf225Q9D7D1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf225Q9D7D1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf225Q9D7D1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf225Q9D7D1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rnf225Q9D7D1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rnf225Q9D7D1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rnf225Q9D7D1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf225Q9D7D1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf225Q9D7D1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf225Q9D7D1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf225Q9D7D1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf225Q9D7D1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf225Q9D7D1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf225Q9D7D1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf225Q9D7D1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf225Q9D7D1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf225Q9D7D1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf225Q9D7D1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf225Q9D7D1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf225Q9D7D1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf225Q9D7D1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf225Q9D7D1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf225Q9D7D1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf225Q9D7D1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf225Q9D7D1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf225Q9D7D1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf225Q9D7D1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf225Q9D7D1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf225Q9D7D1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf225Q9D7D1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf225Q9D7D1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf225Q9D7D1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf225Q9D7D1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf225Q9D7D1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf225Q9D7D1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf225Q9D7D1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf225Q9D7D1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf225Q9D7D1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf225Q9D7D1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf225Q9D7D1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf225Q9D7D1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf225Q9D7D1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf225Q9D7D1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf225Q9D7D1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf225Q9D7D1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf225Q9D7D1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf225Q9D7D1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf225Q9D7D1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf225Q9D7D1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf225Q9D7D1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf225Q9D7D1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf225Q9D7D1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf225Q9D7D1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf225Q9D7D1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf225Q9D7D1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf225Q9D7D1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf225Q9D7D1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf225Q9D7D1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf225Q9D7D1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf225Q9D7D1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf225Q9D7D1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf225Q9D7D1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf225Q9D7D1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf225Q9D7D1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf225Q9D7D1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf225Q9D7D1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf225Q9D7D1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf225Q9D7D1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf225Q9D7D1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf225Q9D7D1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf225Q9D7D1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.5 ms