Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7A6

Srp19, Signal recognition particle 19 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp19Q9D7A6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srp19Q9D7A6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srp19Q9D7A6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srp19Q9D7A6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Srp19Q9D7A6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Srp19Q9D7A6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Srp19Q9D7A6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Srp19Q9D7A6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Srp19Q9D7A6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Srp19Q9D7A6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Srp19Q9D7A6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Srp19Q9D7A6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Srp19Q9D7A6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Srp19Q9D7A6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Srp19Q9D7A6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Srp19Q9D7A6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Srp19Q9D7A6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Srp19Q9D7A6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Srp19Q9D7A6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Srp19Q9D7A6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Srp19Q9D7A6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Srp19Q9D7A6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Srp19Q9D7A6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Srp19Q9D7A6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Srp19Q9D7A6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Srp19Q9D7A6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Srp19Q9D7A6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Srp19Q9D7A6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Srp19Q9D7A6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Srp19Q9D7A6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Srp19Q9D7A6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Srp19Q9D7A6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Srp19Q9D7A6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Srp19Q9D7A6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Srp19Q9D7A6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Srp19Q9D7A6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Srp19Q9D7A6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Srp19Q9D7A6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Srp19Q9D7A6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Srp19Q9D7A6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Srp19Q9D7A6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Srp19Q9D7A6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Srp19Q9D7A6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Srp19Q9D7A6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Srp19Q9D7A6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Srp19Q9D7A6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Srp19Q9D7A6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Srp19Q9D7A6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Srp19Q9D7A6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Srp19Q9D7A6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Srp19Q9D7A6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Srp19Q9D7A6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Srp19Q9D7A6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Srp19Q9D7A6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Srp19Q9D7A6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Srp19Q9D7A6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Srp19Q9D7A6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Srp19Q9D7A6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Srp19Q9D7A6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Srp19Q9D7A6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Srp19Q9D7A6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Srp19Q9D7A6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Srp19Q9D7A6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Srp19Q9D7A6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Srp19Q9D7A6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Srp19Q9D7A6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Srp19Q9D7A6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Srp19Q9D7A6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Srp19Q9D7A6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Srp19Q9D7A6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Srp19Q9D7A6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Srp19Q9D7A6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Srp19Q9D7A6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Srp19Q9D7A6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Srp19Q9D7A6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Srp19Q9D7A6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Srp19Q9D7A6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Srp19Q9D7A6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Srp19Q9D7A6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Srp19Q9D7A6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Srp19Q9D7A6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Srp19Q9D7A6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Srp19Q9D7A6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Srp19Q9D7A6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Srp19Q9D7A6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Srp19Q9D7A6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Srp19Q9D7A6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Srp19Q9D7A6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Srp19Q9D7A6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Srp19Q9D7A6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Srp19Q9D7A6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Srp19Q9D7A6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Srp19Q9D7A6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Srp19Q9D7A6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Srp19Q9D7A6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1068.3 ms