Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MsraQ9D6Y7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MsraQ9D6Y7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MsraQ9D6Y7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MsraQ9D6Y7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MsraQ9D6Y7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MsraQ9D6Y7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MsraQ9D6Y7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MsraQ9D6Y7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MsraQ9D6Y7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MsraQ9D6Y7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MsraQ9D6Y7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MsraQ9D6Y7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MsraQ9D6Y7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MsraQ9D6Y7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MsraQ9D6Y7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MsraQ9D6Y7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MsraQ9D6Y7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MsraQ9D6Y7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MsraQ9D6Y7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MsraQ9D6Y7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MsraQ9D6Y7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MsraQ9D6Y7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MsraQ9D6Y7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MsraQ9D6Y7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MsraQ9D6Y7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MsraQ9D6Y7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MsraQ9D6Y7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MsraQ9D6Y7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MsraQ9D6Y7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MsraQ9D6Y7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MsraQ9D6Y7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MsraQ9D6Y7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MsraQ9D6Y7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MsraQ9D6Y7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MsraQ9D6Y7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MsraQ9D6Y7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MsraQ9D6Y7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MsraQ9D6Y7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MsraQ9D6Y7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MsraQ9D6Y7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MsraQ9D6Y7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MsraQ9D6Y7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MsraQ9D6Y7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MsraQ9D6Y7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MsraQ9D6Y7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MsraQ9D6Y7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MsraQ9D6Y7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MsraQ9D6Y7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MsraQ9D6Y7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MsraQ9D6Y7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MsraQ9D6Y7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MsraQ9D6Y7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MsraQ9D6Y7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MsraQ9D6Y7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MsraQ9D6Y7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MsraQ9D6Y7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MsraQ9D6Y7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MsraQ9D6Y7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MsraQ9D6Y7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MsraQ9D6Y7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MsraQ9D6Y7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MsraQ9D6Y7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MsraQ9D6Y7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MsraQ9D6Y7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MsraQ9D6Y7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MsraQ9D6Y7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MsraQ9D6Y7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MsraQ9D6Y7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MsraQ9D6Y7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MsraQ9D6Y7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MsraQ9D6Y7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MsraQ9D6Y7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MsraQ9D6Y7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MsraQ9D6Y7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MsraQ9D6Y7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MsraQ9D6Y7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MsraQ9D6Y7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MsraQ9D6Y7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MsraQ9D6Y7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MsraQ9D6Y7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MsraQ9D6Y7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MsraQ9D6Y7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MsraQ9D6Y7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MsraQ9D6Y7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MsraQ9D6Y7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MsraQ9D6Y7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MsraQ9D6Y7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MsraQ9D6Y7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MsraQ9D6Y7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MsraQ9D6Y7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MsraQ9D6Y7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MsraQ9D6Y7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MsraQ9D6Y7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MsraQ9D6Y7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MsraQ9D6Y7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
MsraQ9D6Y7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MsraQ9D6Y7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
MsraQ9D6Y7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MsraQ9D6Y7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms