Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V4

Taf1d, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, mousemouse

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Length 322 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1dQ9D4V4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Taf1dQ9D4V4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Taf1dQ9D4V4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Taf1dQ9D4V4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Taf1dQ9D4V4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Taf1dQ9D4V4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Taf1dQ9D4V4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Taf1dQ9D4V4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Taf1dQ9D4V4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Taf1dQ9D4V4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Taf1dQ9D4V4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Taf1dQ9D4V4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Taf1dQ9D4V4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Taf1dQ9D4V4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Taf1dQ9D4V4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Taf1dQ9D4V4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Taf1dQ9D4V4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Taf1dQ9D4V4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Taf1dQ9D4V4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Taf1dQ9D4V4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Taf1dQ9D4V4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Taf1dQ9D4V4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Taf1dQ9D4V4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Taf1dQ9D4V4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Taf1dQ9D4V4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Taf1dQ9D4V4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Taf1dQ9D4V4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Taf1dQ9D4V4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Taf1dQ9D4V4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Taf1dQ9D4V4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Taf1dQ9D4V4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Taf1dQ9D4V4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Taf1dQ9D4V4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Taf1dQ9D4V4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Taf1dQ9D4V4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Taf1dQ9D4V4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Taf1dQ9D4V4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Taf1dQ9D4V4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Taf1dQ9D4V4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Taf1dQ9D4V4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Taf1dQ9D4V4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Taf1dQ9D4V4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Taf1dQ9D4V4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Taf1dQ9D4V4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Taf1dQ9D4V4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Taf1dQ9D4V4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Taf1dQ9D4V4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Taf1dQ9D4V4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Taf1dQ9D4V4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Taf1dQ9D4V4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Taf1dQ9D4V4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Taf1dQ9D4V4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Taf1dQ9D4V4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Taf1dQ9D4V4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Taf1dQ9D4V4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Taf1dQ9D4V4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Taf1dQ9D4V4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Taf1dQ9D4V4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Taf1dQ9D4V4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Taf1dQ9D4V4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Taf1dQ9D4V4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Taf1dQ9D4V4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Taf1dQ9D4V4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Taf1dQ9D4V4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Taf1dQ9D4V4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Taf1dQ9D4V4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Taf1dQ9D4V4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Taf1dQ9D4V4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Taf1dQ9D4V4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Taf1dQ9D4V4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Taf1dQ9D4V4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Taf1dQ9D4V4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Taf1dQ9D4V4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Taf1dQ9D4V4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Taf1dQ9D4V4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Taf1dQ9D4V4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Taf1dQ9D4V4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Taf1dQ9D4V4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Taf1dQ9D4V4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Taf1dQ9D4V4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Taf1dQ9D4V4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Taf1dQ9D4V4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Taf1dQ9D4V4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Taf1dQ9D4V4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Taf1dQ9D4V4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Taf1dQ9D4V4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Taf1dQ9D4V4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Taf1dQ9D4V4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Taf1dQ9D4V4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Taf1dQ9D4V4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Taf1dQ9D4V4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Taf1dQ9D4V4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Taf1dQ9D4V4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Taf1dQ9D4V4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Taf1dQ9D4V4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Taf1dQ9D4V4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Taf1dQ9D4V4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Taf1dQ9D4V4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Taf1dQ9D4V4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Taf1dQ9D4V4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
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