Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tubgcp4Q9D4F8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tubgcp4Q9D4F8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tubgcp4Q9D4F8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tubgcp4Q9D4F8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tubgcp4Q9D4F8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tubgcp4Q9D4F8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tubgcp4Q9D4F8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Tubgcp4Q9D4F8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Tubgcp4Q9D4F8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Tubgcp4Q9D4F8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tubgcp4Q9D4F8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tubgcp4Q9D4F8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tubgcp4Q9D4F8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tubgcp4Q9D4F8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tubgcp4Q9D4F8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tubgcp4Q9D4F8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tubgcp4Q9D4F8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tubgcp4Q9D4F8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tubgcp4Q9D4F8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tubgcp4Q9D4F8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tubgcp4Q9D4F8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tubgcp4Q9D4F8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tubgcp4Q9D4F8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tubgcp4Q9D4F8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tubgcp4Q9D4F8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubgcp4Q9D4F8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubgcp4Q9D4F8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubgcp4Q9D4F8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubgcp4Q9D4F8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubgcp4Q9D4F8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubgcp4Q9D4F8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubgcp4Q9D4F8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubgcp4Q9D4F8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubgcp4Q9D4F8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubgcp4Q9D4F8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubgcp4Q9D4F8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubgcp4Q9D4F8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubgcp4Q9D4F8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubgcp4Q9D4F8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubgcp4Q9D4F8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubgcp4Q9D4F8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubgcp4Q9D4F8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubgcp4Q9D4F8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tubgcp4Q9D4F8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tubgcp4Q9D4F8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tubgcp4Q9D4F8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tubgcp4Q9D4F8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tubgcp4Q9D4F8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tubgcp4Q9D4F8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tubgcp4Q9D4F8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tubgcp4Q9D4F8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tubgcp4Q9D4F8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tubgcp4Q9D4F8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tubgcp4Q9D4F8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tubgcp4Q9D4F8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tubgcp4Q9D4F8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tubgcp4Q9D4F8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tubgcp4Q9D4F8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tubgcp4Q9D4F8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tubgcp4Q9D4F8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tubgcp4Q9D4F8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tubgcp4Q9D4F8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tubgcp4Q9D4F8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tubgcp4Q9D4F8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tubgcp4Q9D4F8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tubgcp4Q9D4F8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tubgcp4Q9D4F8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tubgcp4Q9D4F8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tubgcp4Q9D4F8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tubgcp4Q9D4F8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tubgcp4Q9D4F8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tubgcp4Q9D4F8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tubgcp4Q9D4F8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tubgcp4Q9D4F8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tubgcp4Q9D4F8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tubgcp4Q9D4F8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tubgcp4Q9D4F8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tubgcp4Q9D4F8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tubgcp4Q9D4F8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tubgcp4Q9D4F8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tubgcp4Q9D4F8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tubgcp4Q9D4F8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Tubgcp4Q9D4F8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tubgcp4Q9D4F8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tubgcp4Q9D4F8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tubgcp4Q9D4F8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tubgcp4Q9D4F8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tubgcp4Q9D4F8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tubgcp4Q9D4F8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tubgcp4Q9D4F8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tubgcp4Q9D4F8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Tubgcp4Q9D4F8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tubgcp4Q9D4F8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tubgcp4Q9D4F8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tubgcp4Q9D4F8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms