Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2D9

Klhdc8b, Kelch domain-containing protein 8B, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc8bQ9D2D9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhdc8bQ9D2D9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Klhdc8bQ9D2D9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhdc8bQ9D2D9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Klhdc8bQ9D2D9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhdc8bQ9D2D9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhdc8bQ9D2D9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhdc8bQ9D2D9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Klhdc8bQ9D2D9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klhdc8bQ9D2D9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Klhdc8bQ9D2D9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Klhdc8bQ9D2D9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klhdc8bQ9D2D9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klhdc8bQ9D2D9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Klhdc8bQ9D2D9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klhdc8bQ9D2D9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Klhdc8bQ9D2D9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhdc8bQ9D2D9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhdc8bQ9D2D9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhdc8bQ9D2D9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhdc8bQ9D2D9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhdc8bQ9D2D9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhdc8bQ9D2D9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhdc8bQ9D2D9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhdc8bQ9D2D9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhdc8bQ9D2D9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhdc8bQ9D2D9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhdc8bQ9D2D9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhdc8bQ9D2D9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhdc8bQ9D2D9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhdc8bQ9D2D9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhdc8bQ9D2D9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhdc8bQ9D2D9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhdc8bQ9D2D9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhdc8bQ9D2D9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhdc8bQ9D2D9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhdc8bQ9D2D9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhdc8bQ9D2D9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhdc8bQ9D2D9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhdc8bQ9D2D9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhdc8bQ9D2D9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhdc8bQ9D2D9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhdc8bQ9D2D9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhdc8bQ9D2D9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhdc8bQ9D2D9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhdc8bQ9D2D9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhdc8bQ9D2D9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhdc8bQ9D2D9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhdc8bQ9D2D9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhdc8bQ9D2D9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhdc8bQ9D2D9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhdc8bQ9D2D9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhdc8bQ9D2D9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhdc8bQ9D2D9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhdc8bQ9D2D9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klhdc8bQ9D2D9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klhdc8bQ9D2D9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klhdc8bQ9D2D9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klhdc8bQ9D2D9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klhdc8bQ9D2D9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klhdc8bQ9D2D9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klhdc8bQ9D2D9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Klhdc8bQ9D2D9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhdc8bQ9D2D9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhdc8bQ9D2D9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhdc8bQ9D2D9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhdc8bQ9D2D9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhdc8bQ9D2D9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klhdc8bQ9D2D9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klhdc8bQ9D2D9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klhdc8bQ9D2D9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klhdc8bQ9D2D9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhdc8bQ9D2D9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhdc8bQ9D2D9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhdc8bQ9D2D9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhdc8bQ9D2D9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhdc8bQ9D2D9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhdc8bQ9D2D9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhdc8bQ9D2D9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhdc8bQ9D2D9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhdc8bQ9D2D9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhdc8bQ9D2D9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhdc8bQ9D2D9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhdc8bQ9D2D9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhdc8bQ9D2D9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhdc8bQ9D2D9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhdc8bQ9D2D9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhdc8bQ9D2D9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhdc8bQ9D2D9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhdc8bQ9D2D9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhdc8bQ9D2D9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhdc8bQ9D2D9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhdc8bQ9D2D9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhdc8bQ9D2D9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhdc8bQ9D2D9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klhdc8bQ9D2D9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klhdc8bQ9D2D9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klhdc8bQ9D2D9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klhdc8bQ9D2D9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klhdc8bQ9D2D9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms