Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Spns3Q9D232 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Spns3Q9D232 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Spns3Q9D232 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Spns3Q9D232 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Spns3Q9D232 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Spns3Q9D232 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Spns3Q9D232 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Spns3Q9D232 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Spns3Q9D232 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Spns3Q9D232 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Spns3Q9D232 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Spns3Q9D232 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Spns3Q9D232 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Spns3Q9D232 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Spns3Q9D232 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Spns3Q9D232 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Spns3Q9D232 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Spns3Q9D232 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Spns3Q9D232 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Spns3Q9D232 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Spns3Q9D232 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Spns3Q9D232 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Spns3Q9D232 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Spns3Q9D232 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Spns3Q9D232 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Spns3Q9D232 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Spns3Q9D232 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Spns3Q9D232 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Spns3Q9D232 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Spns3Q9D232 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Spns3Q9D232 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Spns3Q9D232 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Spns3Q9D232 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Spns3Q9D232 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Spns3Q9D232 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Spns3Q9D232 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Spns3Q9D232 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Spns3Q9D232 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Spns3Q9D232 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Spns3Q9D232 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Spns3Q9D232 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Spns3Q9D232 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Spns3Q9D232 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Spns3Q9D232 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Spns3Q9D232 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Spns3Q9D232 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Spns3Q9D232 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Spns3Q9D232 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Spns3Q9D232 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Spns3Q9D232 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Spns3Q9D232 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Spns3Q9D232 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Spns3Q9D232 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Spns3Q9D232 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Spns3Q9D232 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Spns3Q9D232 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Spns3Q9D232 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Spns3Q9D232 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Spns3Q9D232 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Spns3Q9D232 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Spns3Q9D232 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Spns3Q9D232 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Spns3Q9D232 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Spns3Q9D232 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Spns3Q9D232 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Spns3Q9D232 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Spns3Q9D232 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Spns3Q9D232 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Spns3Q9D232 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Spns3Q9D232 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Spns3Q9D232 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Spns3Q9D232 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Spns3Q9D232 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Spns3Q9D232 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Spns3Q9D232 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Spns3Q9D232 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Spns3Q9D232 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Spns3Q9D232 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Spns3Q9D232 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Spns3Q9D232 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Spns3Q9D232 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Spns3Q9D232 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Spns3Q9D232 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Spns3Q9D232 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Spns3Q9D232 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Spns3Q9D232 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Spns3Q9D232 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Spns3Q9D232 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Spns3Q9D232 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Spns3Q9D232 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Spns3Q9D232 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Spns3Q9D232 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Spns3Q9D232 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Spns3Q9D232 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Spns3Q9D232 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Spns3Q9D232 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Spns3Q9D232 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Spns3Q9D232 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Spns3Q9D232 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
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