Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1L0

Chchd2, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd2Q9D1L0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chchd2Q9D1L0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chchd2Q9D1L0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chchd2Q9D1L0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chchd2Q9D1L0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chchd2Q9D1L0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chchd2Q9D1L0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chchd2Q9D1L0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chchd2Q9D1L0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chchd2Q9D1L0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chchd2Q9D1L0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chchd2Q9D1L0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chchd2Q9D1L0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chchd2Q9D1L0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chchd2Q9D1L0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chchd2Q9D1L0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chchd2Q9D1L0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chchd2Q9D1L0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chchd2Q9D1L0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chchd2Q9D1L0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chchd2Q9D1L0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chchd2Q9D1L0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chchd2Q9D1L0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chchd2Q9D1L0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chchd2Q9D1L0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chchd2Q9D1L0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chchd2Q9D1L0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chchd2Q9D1L0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chchd2Q9D1L0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chchd2Q9D1L0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chchd2Q9D1L0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chchd2Q9D1L0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chchd2Q9D1L0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chchd2Q9D1L0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chchd2Q9D1L0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chchd2Q9D1L0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chchd2Q9D1L0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chchd2Q9D1L0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chchd2Q9D1L0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chchd2Q9D1L0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chchd2Q9D1L0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chchd2Q9D1L0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chchd2Q9D1L0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chchd2Q9D1L0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chchd2Q9D1L0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chchd2Q9D1L0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chchd2Q9D1L0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chchd2Q9D1L0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chchd2Q9D1L0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chchd2Q9D1L0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chchd2Q9D1L0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chchd2Q9D1L0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chchd2Q9D1L0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chchd2Q9D1L0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chchd2Q9D1L0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chchd2Q9D1L0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chchd2Q9D1L0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chchd2Q9D1L0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chchd2Q9D1L0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chchd2Q9D1L0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chchd2Q9D1L0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chchd2Q9D1L0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chchd2Q9D1L0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chchd2Q9D1L0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chchd2Q9D1L0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chchd2Q9D1L0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chchd2Q9D1L0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chchd2Q9D1L0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chchd2Q9D1L0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chchd2Q9D1L0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chchd2Q9D1L0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chchd2Q9D1L0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chchd2Q9D1L0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chchd2Q9D1L0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chchd2Q9D1L0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chchd2Q9D1L0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chchd2Q9D1L0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chchd2Q9D1L0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chchd2Q9D1L0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chchd2Q9D1L0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chchd2Q9D1L0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chchd2Q9D1L0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chchd2Q9D1L0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chchd2Q9D1L0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chchd2Q9D1L0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chchd2Q9D1L0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chchd2Q9D1L0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Chchd2Q9D1L0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chchd2Q9D1L0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chchd2Q9D1L0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chchd2Q9D1L0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chchd2Q9D1L0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chchd2Q9D1L0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chchd2Q9D1L0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chchd2Q9D1L0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chchd2Q9D1L0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chchd2Q9D1L0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chchd2Q9D1L0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chchd2Q9D1L0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chchd2Q9D1L0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.5 ms