Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1K7

UPF0687 protein C20orf27 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1K7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D1K7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D1K7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D1K7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D1K7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D1K7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D1K7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D1K7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D1K7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D1K7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D1K7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9D1K7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9D1K7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9D1K7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9D1K7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9D1K7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9D1K7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9D1K7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9D1K7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9D1K7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9D1K7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9D1K7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9D1K7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9D1K7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9D1K7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9D1K7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9D1K7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9D1K7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9D1K7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9D1K7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9D1K7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9D1K7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9D1K7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9D1K7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9D1K7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9D1K7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9D1K7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9D1K7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9D1K7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9D1K7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9D1K7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9D1K7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9D1K7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9D1K7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q9D1K7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q9D1K7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q9D1K7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q9D1K7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9D1K7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9D1K7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9D1K7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9D1K7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9D1K7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9D1K7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9D1K7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9D1K7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9D1K7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9D1K7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9D1K7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9D1K7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9D1K7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9D1K7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9D1K7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9D1K7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9D1K7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9D1K7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9D1K7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9D1K7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9D1K7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9D1K7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9D1K7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9D1K7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9D1K7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9D1K7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9D1K7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9D1K7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9D1K7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9D1K7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9D1K7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9D1K7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9D1K7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9D1K7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9D1K7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9D1K7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9D1K7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9D1K7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9D1K7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9D1K7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9D1K7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9D1K7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9D1K7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9D1K7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9D1K7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9D1K7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9D1K7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9D1K7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9D1K7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9D1K7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9D1K7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9D1K7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms