Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tspan11Q9D1D1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tspan11Q9D1D1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tspan11Q9D1D1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tspan11Q9D1D1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tspan11Q9D1D1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tspan11Q9D1D1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tspan11Q9D1D1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tspan11Q9D1D1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tspan11Q9D1D1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Tspan11Q9D1D1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tspan11Q9D1D1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tspan11Q9D1D1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tspan11Q9D1D1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tspan11Q9D1D1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Tspan11Q9D1D1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tspan11Q9D1D1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tspan11Q9D1D1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tspan11Q9D1D1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tspan11Q9D1D1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tspan11Q9D1D1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tspan11Q9D1D1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tspan11Q9D1D1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tspan11Q9D1D1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tspan11Q9D1D1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tspan11Q9D1D1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tspan11Q9D1D1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tspan11Q9D1D1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Tspan11Q9D1D1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Tspan11Q9D1D1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tspan11Q9D1D1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tspan11Q9D1D1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tspan11Q9D1D1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tspan11Q9D1D1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Tspan11Q9D1D1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tspan11Q9D1D1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tspan11Q9D1D1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tspan11Q9D1D1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tspan11Q9D1D1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tspan11Q9D1D1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tspan11Q9D1D1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tspan11Q9D1D1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tspan11Q9D1D1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tspan11Q9D1D1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tspan11Q9D1D1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tspan11Q9D1D1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tspan11Q9D1D1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tspan11Q9D1D1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tspan11Q9D1D1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tspan11Q9D1D1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tspan11Q9D1D1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tspan11Q9D1D1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tspan11Q9D1D1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tspan11Q9D1D1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tspan11Q9D1D1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tspan11Q9D1D1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tspan11Q9D1D1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tspan11Q9D1D1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tspan11Q9D1D1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tspan11Q9D1D1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tspan11Q9D1D1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tspan11Q9D1D1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tspan11Q9D1D1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tspan11Q9D1D1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tspan11Q9D1D1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tspan11Q9D1D1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tspan11Q9D1D1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tspan11Q9D1D1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tspan11Q9D1D1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tspan11Q9D1D1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tspan11Q9D1D1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tspan11Q9D1D1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tspan11Q9D1D1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tspan11Q9D1D1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tspan11Q9D1D1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tspan11Q9D1D1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tspan11Q9D1D1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tspan11Q9D1D1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tspan11Q9D1D1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tspan11Q9D1D1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tspan11Q9D1D1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tspan11Q9D1D1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tspan11Q9D1D1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tspan11Q9D1D1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tspan11Q9D1D1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tspan11Q9D1D1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tspan11Q9D1D1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tspan11Q9D1D1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tspan11Q9D1D1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tspan11Q9D1D1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tspan11Q9D1D1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tspan11Q9D1D1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tspan11Q9D1D1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tspan11Q9D1D1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tspan11Q9D1D1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Tspan11Q9D1D1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tspan11Q9D1D1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tspan11Q9D1D1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tspan11Q9D1D1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tspan11Q9D1D1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms