Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lsm12Q9D0R8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lsm12Q9D0R8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Lsm12Q9D0R8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lsm12Q9D0R8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Lsm12Q9D0R8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lsm12Q9D0R8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Lsm12Q9D0R8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lsm12Q9D0R8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lsm12Q9D0R8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lsm12Q9D0R8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lsm12Q9D0R8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lsm12Q9D0R8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lsm12Q9D0R8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lsm12Q9D0R8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lsm12Q9D0R8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lsm12Q9D0R8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lsm12Q9D0R8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Lsm12Q9D0R8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lsm12Q9D0R8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lsm12Q9D0R8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Lsm12Q9D0R8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lsm12Q9D0R8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lsm12Q9D0R8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lsm12Q9D0R8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lsm12Q9D0R8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lsm12Q9D0R8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lsm12Q9D0R8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lsm12Q9D0R8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lsm12Q9D0R8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lsm12Q9D0R8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lsm12Q9D0R8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lsm12Q9D0R8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lsm12Q9D0R8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lsm12Q9D0R8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lsm12Q9D0R8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lsm12Q9D0R8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lsm12Q9D0R8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lsm12Q9D0R8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lsm12Q9D0R8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Lsm12Q9D0R8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lsm12Q9D0R8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lsm12Q9D0R8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lsm12Q9D0R8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lsm12Q9D0R8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lsm12Q9D0R8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Lsm12Q9D0R8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lsm12Q9D0R8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lsm12Q9D0R8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Lsm12Q9D0R8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lsm12Q9D0R8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lsm12Q9D0R8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lsm12Q9D0R8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lsm12Q9D0R8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lsm12Q9D0R8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lsm12Q9D0R8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lsm12Q9D0R8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lsm12Q9D0R8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lsm12Q9D0R8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lsm12Q9D0R8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lsm12Q9D0R8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lsm12Q9D0R8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lsm12Q9D0R8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lsm12Q9D0R8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lsm12Q9D0R8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lsm12Q9D0R8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lsm12Q9D0R8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Lsm12Q9D0R8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lsm12Q9D0R8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lsm12Q9D0R8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lsm12Q9D0R8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lsm12Q9D0R8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lsm12Q9D0R8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lsm12Q9D0R8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Lsm12Q9D0R8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lsm12Q9D0R8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lsm12Q9D0R8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lsm12Q9D0R8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lsm12Q9D0R8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lsm12Q9D0R8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lsm12Q9D0R8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lsm12Q9D0R8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lsm12Q9D0R8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lsm12Q9D0R8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Lsm12Q9D0R8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Lsm12Q9D0R8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lsm12Q9D0R8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lsm12Q9D0R8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lsm12Q9D0R8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lsm12Q9D0R8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lsm12Q9D0R8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lsm12Q9D0R8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lsm12Q9D0R8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lsm12Q9D0R8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lsm12Q9D0R8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lsm12Q9D0R8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lsm12Q9D0R8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lsm12Q9D0R8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lsm12Q9D0R8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lsm12Q9D0R8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms