Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0I4

Stx17, Syntaxin-17, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx17Q9D0I4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stx17Q9D0I4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stx17Q9D0I4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stx17Q9D0I4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stx17Q9D0I4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stx17Q9D0I4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stx17Q9D0I4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stx17Q9D0I4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Stx17Q9D0I4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stx17Q9D0I4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stx17Q9D0I4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stx17Q9D0I4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stx17Q9D0I4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stx17Q9D0I4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stx17Q9D0I4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stx17Q9D0I4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Stx17Q9D0I4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stx17Q9D0I4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stx17Q9D0I4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Stx17Q9D0I4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stx17Q9D0I4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stx17Q9D0I4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stx17Q9D0I4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stx17Q9D0I4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stx17Q9D0I4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stx17Q9D0I4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stx17Q9D0I4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stx17Q9D0I4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stx17Q9D0I4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stx17Q9D0I4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stx17Q9D0I4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stx17Q9D0I4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stx17Q9D0I4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stx17Q9D0I4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Stx17Q9D0I4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stx17Q9D0I4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stx17Q9D0I4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stx17Q9D0I4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stx17Q9D0I4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stx17Q9D0I4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stx17Q9D0I4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stx17Q9D0I4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stx17Q9D0I4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stx17Q9D0I4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stx17Q9D0I4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stx17Q9D0I4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stx17Q9D0I4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stx17Q9D0I4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stx17Q9D0I4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stx17Q9D0I4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stx17Q9D0I4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Stx17Q9D0I4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stx17Q9D0I4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stx17Q9D0I4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stx17Q9D0I4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stx17Q9D0I4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stx17Q9D0I4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stx17Q9D0I4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stx17Q9D0I4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stx17Q9D0I4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stx17Q9D0I4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stx17Q9D0I4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Stx17Q9D0I4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Stx17Q9D0I4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stx17Q9D0I4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stx17Q9D0I4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stx17Q9D0I4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stx17Q9D0I4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stx17Q9D0I4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stx17Q9D0I4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stx17Q9D0I4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stx17Q9D0I4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stx17Q9D0I4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stx17Q9D0I4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stx17Q9D0I4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stx17Q9D0I4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Stx17Q9D0I4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stx17Q9D0I4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stx17Q9D0I4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stx17Q9D0I4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stx17Q9D0I4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stx17Q9D0I4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stx17Q9D0I4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stx17Q9D0I4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stx17Q9D0I4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stx17Q9D0I4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stx17Q9D0I4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stx17Q9D0I4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stx17Q9D0I4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stx17Q9D0I4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stx17Q9D0I4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stx17Q9D0I4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stx17Q9D0I4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Stx17Q9D0I4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stx17Q9D0I4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stx17Q9D0I4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stx17Q9D0I4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stx17Q9D0I4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stx17Q9D0I4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Stx17Q9D0I4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms