Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXB8

Alpk1, Alpha-protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alpk1Q9CXB8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Alpk1Q9CXB8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Alpk1Q9CXB8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Alpk1Q9CXB8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Alpk1Q9CXB8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Alpk1Q9CXB8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Alpk1Q9CXB8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Alpk1Q9CXB8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Alpk1Q9CXB8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Alpk1Q9CXB8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Alpk1Q9CXB8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Alpk1Q9CXB8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Alpk1Q9CXB8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Alpk1Q9CXB8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Alpk1Q9CXB8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Alpk1Q9CXB8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Alpk1Q9CXB8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Alpk1Q9CXB8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Alpk1Q9CXB8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Alpk1Q9CXB8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Alpk1Q9CXB8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Alpk1Q9CXB8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Alpk1Q9CXB8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Alpk1Q9CXB8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Alpk1Q9CXB8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Alpk1Q9CXB8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Alpk1Q9CXB8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Alpk1Q9CXB8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Alpk1Q9CXB8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Alpk1Q9CXB8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Alpk1Q9CXB8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Alpk1Q9CXB8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Alpk1Q9CXB8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Alpk1Q9CXB8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Alpk1Q9CXB8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Alpk1Q9CXB8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Alpk1Q9CXB8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Alpk1Q9CXB8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Alpk1Q9CXB8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Alpk1Q9CXB8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Alpk1Q9CXB8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Alpk1Q9CXB8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Alpk1Q9CXB8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Alpk1Q9CXB8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Alpk1Q9CXB8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Alpk1Q9CXB8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Alpk1Q9CXB8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Alpk1Q9CXB8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Alpk1Q9CXB8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Alpk1Q9CXB8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Alpk1Q9CXB8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Alpk1Q9CXB8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Alpk1Q9CXB8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Alpk1Q9CXB8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Alpk1Q9CXB8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Alpk1Q9CXB8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Alpk1Q9CXB8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Alpk1Q9CXB8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Alpk1Q9CXB8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Alpk1Q9CXB8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Alpk1Q9CXB8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Alpk1Q9CXB8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Alpk1Q9CXB8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Alpk1Q9CXB8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Alpk1Q9CXB8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Alpk1Q9CXB8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Alpk1Q9CXB8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Alpk1Q9CXB8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Alpk1Q9CXB8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Alpk1Q9CXB8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Alpk1Q9CXB8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Alpk1Q9CXB8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Alpk1Q9CXB8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Alpk1Q9CXB8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Alpk1Q9CXB8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Alpk1Q9CXB8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Alpk1Q9CXB8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Alpk1Q9CXB8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Alpk1Q9CXB8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Alpk1Q9CXB8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Alpk1Q9CXB8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Alpk1Q9CXB8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Alpk1Q9CXB8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Alpk1Q9CXB8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Alpk1Q9CXB8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Alpk1Q9CXB8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Alpk1Q9CXB8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Alpk1Q9CXB8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Alpk1Q9CXB8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Alpk1Q9CXB8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Alpk1Q9CXB8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Alpk1Q9CXB8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Alpk1Q9CXB8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Alpk1Q9CXB8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Alpk1Q9CXB8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Alpk1Q9CXB8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Alpk1Q9CXB8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Alpk1Q9CXB8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Alpk1Q9CXB8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Alpk1Q9CXB8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms